Protein–RNA interactions for Protein: P08151

GLI1, Zinc finger protein GLI1, humanhuman

Predictions only

Length 1,106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI1P08151 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GLI1P08151 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GLI1P08151 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GLI1P08151 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GLI1P08151 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GLI1P08151 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GLI1P08151 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GLI1P08151 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GLI1P08151 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GLI1P08151 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GLI1P08151 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GLI1P08151 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GLI1P08151 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GLI1P08151 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GLI1P08151 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GLI1P08151 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GLI1P08151 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GLI1P08151 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GLI1P08151 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GLI1P08151 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GLI1P08151 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GLI1P08151 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GLI1P08151 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GLI1P08151 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GLI1P08151 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GLI1P08151 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GLI1P08151 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GLI1P08151 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GLI1P08151 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GLI1P08151 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GLI1P08151 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GLI1P08151 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GLI1P08151 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GLI1P08151 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GLI1P08151 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
GLI1P08151 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GLI1P08151 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GLI1P08151 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GLI1P08151 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GLI1P08151 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GLI1P08151 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GLI1P08151 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GLI1P08151 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GLI1P08151 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GLI1P08151 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GLI1P08151 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GLI1P08151 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GLI1P08151 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GLI1P08151 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GLI1P08151 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GLI1P08151 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GLI1P08151 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GLI1P08151 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GLI1P08151 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GLI1P08151 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GLI1P08151 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GLI1P08151 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GLI1P08151 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GLI1P08151 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GLI1P08151 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GLI1P08151 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GLI1P08151 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GLI1P08151 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GLI1P08151 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GLI1P08151 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GLI1P08151 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GLI1P08151 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GLI1P08151 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
GLI1P08151 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GLI1P08151 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GLI1P08151 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GLI1P08151 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
GLI1P08151 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GLI1P08151 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GLI1P08151 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GLI1P08151 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GLI1P08151 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GLI1P08151 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GLI1P08151 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GLI1P08151 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GLI1P08151 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GLI1P08151 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GLI1P08151 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GLI1P08151 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GLI1P08151 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GLI1P08151 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GLI1P08151 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GLI1P08151 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GLI1P08151 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GLI1P08151 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GLI1P08151 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GLI1P08151 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GLI1P08151 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GLI1P08151 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GLI1P08151 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GLI1P08151 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GLI1P08151 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GLI1P08151 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GLI1P08151 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GLI1P08151 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms