Protein–RNA interactions for Protein: P08047

SP1, Transcription factor Sp1, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP1P08047 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SP1P08047 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SP1P08047 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SP1P08047 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SP1P08047 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SP1P08047 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SP1P08047 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SP1P08047 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SP1P08047 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SP1P08047 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SP1P08047 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SP1P08047 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SP1P08047 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SP1P08047 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SP1P08047 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SP1P08047 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SP1P08047 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SP1P08047 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SP1P08047 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SP1P08047 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SP1P08047 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SP1P08047 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SP1P08047 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SP1P08047 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SP1P08047 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SP1P08047 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SP1P08047 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SP1P08047 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SP1P08047 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SP1P08047 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SP1P08047 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SP1P08047 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SP1P08047 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SP1P08047 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SP1P08047 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SP1P08047 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SP1P08047 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SP1P08047 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SP1P08047 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SP1P08047 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SP1P08047 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SP1P08047 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SP1P08047 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SP1P08047 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SP1P08047 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SP1P08047 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SP1P08047 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SP1P08047 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SP1P08047 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SP1P08047 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SP1P08047 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SP1P08047 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SP1P08047 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SP1P08047 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SP1P08047 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SP1P08047 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SP1P08047 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SP1P08047 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SP1P08047 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SP1P08047 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SP1P08047 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SP1P08047 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SP1P08047 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SP1P08047 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SP1P08047 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SP1P08047 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SP1P08047 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SP1P08047 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SP1P08047 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SP1P08047 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SP1P08047 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SP1P08047 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SP1P08047 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SP1P08047 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SP1P08047 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SP1P08047 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SP1P08047 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SP1P08047 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SP1P08047 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21■□□□□ 0.95
SP1P08047 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SP1P08047 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SP1P08047 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SP1P08047 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SP1P08047 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SP1P08047 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SP1P08047 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SP1P08047 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SP1P08047 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SP1P08047 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SP1P08047 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SP1P08047 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SP1P08047 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SP1P08047 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SP1P08047 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SP1P08047 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SP1P08047 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SP1P08047 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SP1P08047 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SP1P08047 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SP1P08047 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms