Protein–RNA interactions for Protein: P05549

TFAP2A, Transcription factor AP-2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAP2AP05549 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TFAP2AP05549 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TFAP2AP05549 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TFAP2AP05549 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TFAP2AP05549 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TFAP2AP05549 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TFAP2AP05549 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TFAP2AP05549 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TFAP2AP05549 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TFAP2AP05549 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TFAP2AP05549 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TFAP2AP05549 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TFAP2AP05549 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TFAP2AP05549 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TFAP2AP05549 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TFAP2AP05549 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TFAP2AP05549 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TFAP2AP05549 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TFAP2AP05549 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TFAP2AP05549 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TFAP2AP05549 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TFAP2AP05549 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TFAP2AP05549 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TFAP2AP05549 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TFAP2AP05549 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TFAP2AP05549 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TFAP2AP05549 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TFAP2AP05549 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TFAP2AP05549 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TFAP2AP05549 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TFAP2AP05549 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TFAP2AP05549 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TFAP2AP05549 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TFAP2AP05549 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TFAP2AP05549 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TFAP2AP05549 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TFAP2AP05549 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TFAP2AP05549 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TFAP2AP05549 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TFAP2AP05549 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TFAP2AP05549 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TFAP2AP05549 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TFAP2AP05549 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TFAP2AP05549 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TFAP2AP05549 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TFAP2AP05549 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TFAP2AP05549 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TFAP2AP05549 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TFAP2AP05549 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TFAP2AP05549 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TFAP2AP05549 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TFAP2AP05549 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TFAP2AP05549 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TFAP2AP05549 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TFAP2AP05549 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TFAP2AP05549 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TFAP2AP05549 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TFAP2AP05549 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TFAP2AP05549 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TFAP2AP05549 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TFAP2AP05549 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TFAP2AP05549 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TFAP2AP05549 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TFAP2AP05549 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TFAP2AP05549 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TFAP2AP05549 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TFAP2AP05549 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TFAP2AP05549 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TFAP2AP05549 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TFAP2AP05549 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TFAP2AP05549 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TFAP2AP05549 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TFAP2AP05549 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TFAP2AP05549 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TFAP2AP05549 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TFAP2AP05549 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TFAP2AP05549 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TFAP2AP05549 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TFAP2AP05549 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TFAP2AP05549 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TFAP2AP05549 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TFAP2AP05549 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TFAP2AP05549 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TFAP2AP05549 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TFAP2AP05549 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TFAP2AP05549 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TFAP2AP05549 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TFAP2AP05549 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TFAP2AP05549 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TFAP2AP05549 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TFAP2AP05549 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TFAP2AP05549 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TFAP2AP05549 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TFAP2AP05549 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TFAP2AP05549 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TFAP2AP05549 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TFAP2AP05549 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TFAP2AP05549 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TFAP2AP05549 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TFAP2AP05549 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms