Protein–RNA interactions for Protein: P05000

IFNW1, Interferon omega-1, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNW1P05000 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFNW1P05000 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFNW1P05000 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFNW1P05000 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFNW1P05000 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFNW1P05000 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFNW1P05000 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFNW1P05000 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFNW1P05000 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
IFNW1P05000 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFNW1P05000 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFNW1P05000 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFNW1P05000 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFNW1P05000 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFNW1P05000 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFNW1P05000 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFNW1P05000 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFNW1P05000 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFNW1P05000 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFNW1P05000 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFNW1P05000 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFNW1P05000 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFNW1P05000 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFNW1P05000 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
IFNW1P05000 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
IFNW1P05000 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFNW1P05000 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFNW1P05000 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IFNW1P05000 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IFNW1P05000 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IFNW1P05000 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IFNW1P05000 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IFNW1P05000 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IFNW1P05000 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
IFNW1P05000 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IFNW1P05000 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
IFNW1P05000 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IFNW1P05000 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
IFNW1P05000 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
IFNW1P05000 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IFNW1P05000 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IFNW1P05000 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
IFNW1P05000 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IFNW1P05000 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IFNW1P05000 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IFNW1P05000 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IFNW1P05000 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IFNW1P05000 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IFNW1P05000 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IFNW1P05000 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
IFNW1P05000 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
IFNW1P05000 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IFNW1P05000 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
IFNW1P05000 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IFNW1P05000 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IFNW1P05000 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
IFNW1P05000 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IFNW1P05000 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IFNW1P05000 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IFNW1P05000 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IFNW1P05000 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IFNW1P05000 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IFNW1P05000 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IFNW1P05000 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFNW1P05000 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFNW1P05000 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
IFNW1P05000 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
IFNW1P05000 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.29■■□□□ 1
IFNW1P05000 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IFNW1P05000 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.29■■□□□ 1
IFNW1P05000 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IFNW1P05000 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFNW1P05000 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFNW1P05000 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFNW1P05000 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
IFNW1P05000 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IFNW1P05000 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFNW1P05000 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFNW1P05000 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
IFNW1P05000 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFNW1P05000 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IFNW1P05000 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFNW1P05000 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
IFNW1P05000 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFNW1P05000 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.28■■□□□ 1
IFNW1P05000 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IFNW1P05000 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IFNW1P05000 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IFNW1P05000 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
IFNW1P05000 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
IFNW1P05000 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IFNW1P05000 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
IFNW1P05000 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.27■■□□□ 1
IFNW1P05000 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
IFNW1P05000 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
IFNW1P05000 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IFNW1P05000 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
IFNW1P05000 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
IFNW1P05000 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
IFNW1P05000 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms