Protein–RNA interactions for Protein: P01037

CST1, Cystatin-SN, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CST1P01037 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CST1P01037 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CST1P01037 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CST1P01037 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CST1P01037 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CST1P01037 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CST1P01037 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CST1P01037 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CST1P01037 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CST1P01037 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CST1P01037 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CST1P01037 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CST1P01037 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CST1P01037 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CST1P01037 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CST1P01037 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CST1P01037 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CST1P01037 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CST1P01037 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CST1P01037 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CST1P01037 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CST1P01037 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CST1P01037 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CST1P01037 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CST1P01037 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CST1P01037 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CST1P01037 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CST1P01037 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CST1P01037 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CST1P01037 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CST1P01037 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CST1P01037 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CST1P01037 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CST1P01037 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CST1P01037 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CST1P01037 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CST1P01037 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CST1P01037 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CST1P01037 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CST1P01037 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CST1P01037 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CST1P01037 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CST1P01037 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CST1P01037 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CST1P01037 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CST1P01037 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CST1P01037 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CST1P01037 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CST1P01037 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CST1P01037 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CST1P01037 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CST1P01037 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CST1P01037 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CST1P01037 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CST1P01037 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CST1P01037 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CST1P01037 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CST1P01037 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CST1P01037 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CST1P01037 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CST1P01037 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CST1P01037 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CST1P01037 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CST1P01037 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CST1P01037 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CST1P01037 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CST1P01037 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CST1P01037 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CST1P01037 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CST1P01037 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CST1P01037 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CST1P01037 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CST1P01037 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CST1P01037 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CST1P01037 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CST1P01037 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CST1P01037 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CST1P01037 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CST1P01037 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CST1P01037 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CST1P01037 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CST1P01037 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CST1P01037 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CST1P01037 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CST1P01037 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CST1P01037 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CST1P01037 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CST1P01037 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CST1P01037 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CST1P01037 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CST1P01037 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CST1P01037 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CST1P01037 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CST1P01037 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CST1P01037 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CST1P01037 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CST1P01037 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CST1P01037 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CST1P01037 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CST1P01037 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.7 ms