Protein–RNA interactions for Protein: O96015

DNAL4, Dynein light chain 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAL4O96015 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DNAL4O96015 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DNAL4O96015 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DNAL4O96015 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DNAL4O96015 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAL4O96015 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAL4O96015 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAL4O96015 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAL4O96015 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAL4O96015 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAL4O96015 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAL4O96015 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAL4O96015 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAL4O96015 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAL4O96015 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAL4O96015 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAL4O96015 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAL4O96015 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAL4O96015 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAL4O96015 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAL4O96015 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAL4O96015 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAL4O96015 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAL4O96015 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAL4O96015 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAL4O96015 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAL4O96015 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNAL4O96015 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNAL4O96015 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNAL4O96015 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNAL4O96015 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNAL4O96015 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNAL4O96015 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNAL4O96015 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNAL4O96015 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNAL4O96015 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNAL4O96015 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNAL4O96015 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNAL4O96015 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNAL4O96015 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNAL4O96015 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNAL4O96015 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNAL4O96015 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNAL4O96015 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNAL4O96015 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNAL4O96015 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNAL4O96015 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAL4O96015 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAL4O96015 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAL4O96015 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAL4O96015 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAL4O96015 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAL4O96015 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAL4O96015 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAL4O96015 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAL4O96015 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAL4O96015 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAL4O96015 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAL4O96015 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAL4O96015 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAL4O96015 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAL4O96015 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAL4O96015 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAL4O96015 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAL4O96015 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAL4O96015 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAL4O96015 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAL4O96015 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAL4O96015 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAL4O96015 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAL4O96015 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAL4O96015 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAL4O96015 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAL4O96015 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAL4O96015 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAL4O96015 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAL4O96015 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAL4O96015 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAL4O96015 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAL4O96015 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAL4O96015 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAL4O96015 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DNAL4O96015 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DNAL4O96015 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DNAL4O96015 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DNAL4O96015 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DNAL4O96015 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DNAL4O96015 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DNAL4O96015 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DNAL4O96015 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DNAL4O96015 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DNAL4O96015 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DNAL4O96015 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DNAL4O96015 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DNAL4O96015 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DNAL4O96015 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DNAL4O96015 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNAL4O96015 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNAL4O96015 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNAL4O96015 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms