Protein–RNA interactions for Protein: O95977

S1PR4, Sphingosine 1-phosphate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S1PR4O95977 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
S1PR4O95977 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
S1PR4O95977 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
S1PR4O95977 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
S1PR4O95977 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
S1PR4O95977 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
S1PR4O95977 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
S1PR4O95977 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
S1PR4O95977 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
S1PR4O95977 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
S1PR4O95977 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
S1PR4O95977 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
S1PR4O95977 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
S1PR4O95977 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
S1PR4O95977 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
S1PR4O95977 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
S1PR4O95977 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
S1PR4O95977 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
S1PR4O95977 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
S1PR4O95977 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
S1PR4O95977 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
S1PR4O95977 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
S1PR4O95977 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
S1PR4O95977 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
S1PR4O95977 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
S1PR4O95977 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
S1PR4O95977 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
S1PR4O95977 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
S1PR4O95977 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
S1PR4O95977 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
S1PR4O95977 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
S1PR4O95977 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
S1PR4O95977 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
S1PR4O95977 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
S1PR4O95977 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
S1PR4O95977 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
S1PR4O95977 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
S1PR4O95977 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
S1PR4O95977 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
S1PR4O95977 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
S1PR4O95977 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
S1PR4O95977 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
S1PR4O95977 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
S1PR4O95977 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
S1PR4O95977 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
S1PR4O95977 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
S1PR4O95977 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
S1PR4O95977 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
S1PR4O95977 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
S1PR4O95977 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
S1PR4O95977 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
S1PR4O95977 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
S1PR4O95977 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
S1PR4O95977 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
S1PR4O95977 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
S1PR4O95977 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
S1PR4O95977 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
S1PR4O95977 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
S1PR4O95977 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
S1PR4O95977 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
S1PR4O95977 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
S1PR4O95977 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
S1PR4O95977 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
S1PR4O95977 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
S1PR4O95977 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
S1PR4O95977 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
S1PR4O95977 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
S1PR4O95977 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
S1PR4O95977 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
S1PR4O95977 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
S1PR4O95977 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
S1PR4O95977 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
S1PR4O95977 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
S1PR4O95977 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
S1PR4O95977 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
S1PR4O95977 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
S1PR4O95977 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
S1PR4O95977 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
S1PR4O95977 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
S1PR4O95977 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
S1PR4O95977 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
S1PR4O95977 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
S1PR4O95977 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
S1PR4O95977 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
S1PR4O95977 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
S1PR4O95977 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
S1PR4O95977 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
S1PR4O95977 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
S1PR4O95977 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
S1PR4O95977 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
S1PR4O95977 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
S1PR4O95977 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
S1PR4O95977 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
S1PR4O95977 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
S1PR4O95977 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
S1PR4O95977 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
S1PR4O95977 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
S1PR4O95977 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
S1PR4O95977 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
S1PR4O95977 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms