Protein–RNA interactions for Protein: O95900

TRUB2, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase TRUB2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRUB2O95900 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRUB2O95900 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRUB2O95900 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRUB2O95900 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRUB2O95900 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRUB2O95900 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRUB2O95900 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRUB2O95900 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRUB2O95900 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TRUB2O95900 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRUB2O95900 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRUB2O95900 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRUB2O95900 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRUB2O95900 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRUB2O95900 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRUB2O95900 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRUB2O95900 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRUB2O95900 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRUB2O95900 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRUB2O95900 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRUB2O95900 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRUB2O95900 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRUB2O95900 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRUB2O95900 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRUB2O95900 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRUB2O95900 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRUB2O95900 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TRUB2O95900 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRUB2O95900 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRUB2O95900 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRUB2O95900 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRUB2O95900 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRUB2O95900 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRUB2O95900 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRUB2O95900 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRUB2O95900 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRUB2O95900 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRUB2O95900 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRUB2O95900 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRUB2O95900 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRUB2O95900 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRUB2O95900 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRUB2O95900 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRUB2O95900 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRUB2O95900 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TRUB2O95900 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRUB2O95900 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRUB2O95900 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRUB2O95900 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRUB2O95900 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRUB2O95900 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRUB2O95900 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TRUB2O95900 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRUB2O95900 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRUB2O95900 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRUB2O95900 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRUB2O95900 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRUB2O95900 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TRUB2O95900 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRUB2O95900 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRUB2O95900 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRUB2O95900 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRUB2O95900 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRUB2O95900 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TRUB2O95900 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRUB2O95900 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRUB2O95900 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRUB2O95900 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRUB2O95900 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRUB2O95900 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRUB2O95900 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRUB2O95900 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRUB2O95900 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRUB2O95900 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRUB2O95900 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRUB2O95900 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRUB2O95900 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TRUB2O95900 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRUB2O95900 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRUB2O95900 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRUB2O95900 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRUB2O95900 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRUB2O95900 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRUB2O95900 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRUB2O95900 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRUB2O95900 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRUB2O95900 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRUB2O95900 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRUB2O95900 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRUB2O95900 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRUB2O95900 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRUB2O95900 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRUB2O95900 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRUB2O95900 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRUB2O95900 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRUB2O95900 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRUB2O95900 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRUB2O95900 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRUB2O95900 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TRUB2O95900 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms