Protein–RNA interactions for Protein: O95521

PRAMEF1, PRAME family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF1O95521 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRAMEF1O95521 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRAMEF1O95521 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRAMEF1O95521 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRAMEF1O95521 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRAMEF1O95521 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRAMEF1O95521 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRAMEF1O95521 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PRAMEF1O95521 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PRAMEF1O95521 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PRAMEF1O95521 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRAMEF1O95521 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAMEF1O95521 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAMEF1O95521 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAMEF1O95521 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAMEF1O95521 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAMEF1O95521 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAMEF1O95521 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAMEF1O95521 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAMEF1O95521 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAMEF1O95521 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF1O95521 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF1O95521 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF1O95521 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF1O95521 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF1O95521 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF1O95521 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF1O95521 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF1O95521 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF1O95521 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF1O95521 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAMEF1O95521 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAMEF1O95521 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAMEF1O95521 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAMEF1O95521 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAMEF1O95521 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAMEF1O95521 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAMEF1O95521 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAMEF1O95521 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAMEF1O95521 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAMEF1O95521 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAMEF1O95521 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAMEF1O95521 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF1O95521 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF1O95521 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF1O95521 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF1O95521 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF1O95521 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF1O95521 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF1O95521 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF1O95521 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF1O95521 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF1O95521 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF1O95521 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF1O95521 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRAMEF1O95521 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRAMEF1O95521 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRAMEF1O95521 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PRAMEF1O95521 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PRAMEF1O95521 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRAMEF1O95521 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRAMEF1O95521 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRAMEF1O95521 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRAMEF1O95521 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF1O95521 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF1O95521 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF1O95521 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF1O95521 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF1O95521 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF1O95521 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF1O95521 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF1O95521 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF1O95521 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF1O95521 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF1O95521 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF1O95521 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF1O95521 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF1O95521 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEF1O95521 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEF1O95521 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEF1O95521 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEF1O95521 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEF1O95521 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEF1O95521 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEF1O95521 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEF1O95521 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEF1O95521 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEF1O95521 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEF1O95521 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEF1O95521 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEF1O95521 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEF1O95521 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEF1O95521 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEF1O95521 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEF1O95521 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEF1O95521 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEF1O95521 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEF1O95521 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEF1O95521 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEF1O95521 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms