Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SEC24BO95487 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SEC24BO95487 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SEC24BO95487 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SEC24BO95487 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SEC24BO95487 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SEC24BO95487 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SEC24BO95487 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SEC24BO95487 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SEC24BO95487 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SEC24BO95487 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SEC24BO95487 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SEC24BO95487 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SEC24BO95487 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SEC24BO95487 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SEC24BO95487 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SEC24BO95487 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SEC24BO95487 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SEC24BO95487 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SEC24BO95487 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SEC24BO95487 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SEC24BO95487 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SEC24BO95487 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SEC24BO95487 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SEC24BO95487 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SEC24BO95487 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SEC24BO95487 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SEC24BO95487 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SEC24BO95487 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SEC24BO95487 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SEC24BO95487 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SEC24BO95487 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SEC24BO95487 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SEC24BO95487 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SEC24BO95487 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SEC24BO95487 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SEC24BO95487 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SEC24BO95487 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SEC24BO95487 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SEC24BO95487 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SEC24BO95487 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SEC24BO95487 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SEC24BO95487 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SEC24BO95487 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SEC24BO95487 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SEC24BO95487 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SEC24BO95487 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SEC24BO95487 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SEC24BO95487 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SEC24BO95487 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SEC24BO95487 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SEC24BO95487 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SEC24BO95487 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SEC24BO95487 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SEC24BO95487 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SEC24BO95487 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SEC24BO95487 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SEC24BO95487 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SEC24BO95487 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SEC24BO95487 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SEC24BO95487 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SEC24BO95487 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SEC24BO95487 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SEC24BO95487 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SEC24BO95487 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SEC24BO95487 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SEC24BO95487 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SEC24BO95487 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SEC24BO95487 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SEC24BO95487 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SEC24BO95487 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SEC24BO95487 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SEC24BO95487 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SEC24BO95487 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SEC24BO95487 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SEC24BO95487 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SEC24BO95487 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SEC24BO95487 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SEC24BO95487 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SEC24BO95487 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SEC24BO95487 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SEC24BO95487 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SEC24BO95487 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SEC24BO95487 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SEC24BO95487 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SEC24BO95487 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SEC24BO95487 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SEC24BO95487 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SEC24BO95487 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SEC24BO95487 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SEC24BO95487 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SEC24BO95487 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SEC24BO95487 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SEC24BO95487 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SEC24BO95487 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SEC24BO95487 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SEC24BO95487 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SEC24BO95487 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SEC24BO95487 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SEC24BO95487 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.4 ms