Protein–RNA interactions for Protein: O95460

MATN4, Matrilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATN4O95460 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MATN4O95460 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MATN4O95460 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MATN4O95460 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MATN4O95460 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MATN4O95460 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MATN4O95460 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MATN4O95460 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MATN4O95460 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MATN4O95460 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MATN4O95460 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MATN4O95460 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MATN4O95460 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MATN4O95460 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MATN4O95460 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MATN4O95460 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MATN4O95460 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MATN4O95460 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MATN4O95460 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MATN4O95460 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MATN4O95460 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MATN4O95460 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MATN4O95460 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MATN4O95460 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MATN4O95460 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MATN4O95460 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MATN4O95460 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MATN4O95460 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MATN4O95460 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MATN4O95460 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MATN4O95460 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MATN4O95460 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MATN4O95460 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MATN4O95460 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MATN4O95460 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MATN4O95460 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MATN4O95460 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MATN4O95460 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MATN4O95460 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MATN4O95460 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MATN4O95460 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MATN4O95460 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MATN4O95460 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MATN4O95460 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MATN4O95460 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MATN4O95460 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MATN4O95460 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MATN4O95460 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MATN4O95460 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MATN4O95460 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MATN4O95460 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MATN4O95460 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MATN4O95460 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MATN4O95460 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MATN4O95460 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MATN4O95460 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MATN4O95460 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MATN4O95460 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MATN4O95460 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MATN4O95460 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MATN4O95460 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MATN4O95460 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MATN4O95460 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MATN4O95460 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MATN4O95460 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MATN4O95460 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MATN4O95460 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MATN4O95460 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MATN4O95460 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MATN4O95460 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MATN4O95460 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MATN4O95460 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MATN4O95460 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MATN4O95460 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MATN4O95460 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MATN4O95460 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MATN4O95460 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MATN4O95460 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MATN4O95460 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MATN4O95460 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MATN4O95460 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MATN4O95460 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MATN4O95460 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MATN4O95460 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MATN4O95460 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MATN4O95460 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MATN4O95460 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MATN4O95460 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MATN4O95460 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MATN4O95460 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MATN4O95460 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MATN4O95460 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MATN4O95460 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MATN4O95460 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MATN4O95460 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MATN4O95460 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MATN4O95460 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MATN4O95460 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MATN4O95460 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MATN4O95460 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 174.5 ms