Protein–RNA interactions for Protein: O95455

TGDS, dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGDSO95455 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TGDSO95455 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TGDSO95455 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TGDSO95455 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TGDSO95455 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TGDSO95455 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TGDSO95455 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TGDSO95455 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TGDSO95455 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TGDSO95455 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TGDSO95455 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TGDSO95455 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TGDSO95455 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TGDSO95455 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TGDSO95455 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TGDSO95455 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TGDSO95455 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TGDSO95455 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TGDSO95455 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TGDSO95455 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TGDSO95455 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TGDSO95455 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TGDSO95455 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TGDSO95455 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TGDSO95455 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TGDSO95455 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TGDSO95455 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TGDSO95455 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TGDSO95455 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TGDSO95455 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TGDSO95455 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TGDSO95455 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TGDSO95455 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TGDSO95455 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TGDSO95455 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TGDSO95455 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TGDSO95455 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TGDSO95455 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TGDSO95455 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TGDSO95455 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TGDSO95455 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TGDSO95455 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TGDSO95455 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TGDSO95455 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TGDSO95455 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TGDSO95455 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TGDSO95455 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TGDSO95455 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TGDSO95455 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TGDSO95455 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TGDSO95455 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TGDSO95455 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TGDSO95455 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TGDSO95455 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TGDSO95455 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TGDSO95455 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TGDSO95455 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TGDSO95455 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TGDSO95455 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TGDSO95455 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TGDSO95455 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TGDSO95455 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TGDSO95455 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TGDSO95455 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TGDSO95455 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TGDSO95455 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TGDSO95455 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TGDSO95455 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TGDSO95455 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TGDSO95455 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TGDSO95455 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TGDSO95455 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TGDSO95455 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TGDSO95455 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TGDSO95455 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TGDSO95455 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TGDSO95455 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TGDSO95455 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TGDSO95455 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TGDSO95455 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TGDSO95455 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TGDSO95455 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TGDSO95455 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TGDSO95455 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TGDSO95455 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TGDSO95455 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TGDSO95455 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TGDSO95455 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TGDSO95455 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TGDSO95455 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TGDSO95455 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TGDSO95455 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TGDSO95455 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TGDSO95455 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TGDSO95455 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TGDSO95455 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TGDSO95455 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TGDSO95455 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TGDSO95455 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TGDSO95455 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms