Protein–RNA interactions for Protein: O95409

ZIC2, Zinc finger protein ZIC 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC2O95409 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZIC2O95409 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZIC2O95409 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZIC2O95409 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZIC2O95409 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZIC2O95409 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZIC2O95409 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZIC2O95409 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZIC2O95409 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZIC2O95409 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZIC2O95409 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZIC2O95409 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZIC2O95409 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZIC2O95409 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZIC2O95409 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZIC2O95409 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZIC2O95409 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZIC2O95409 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZIC2O95409 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZIC2O95409 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZIC2O95409 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ZIC2O95409 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZIC2O95409 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZIC2O95409 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZIC2O95409 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZIC2O95409 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZIC2O95409 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZIC2O95409 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZIC2O95409 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ZIC2O95409 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZIC2O95409 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZIC2O95409 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZIC2O95409 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZIC2O95409 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ZIC2O95409 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZIC2O95409 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZIC2O95409 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ZIC2O95409 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZIC2O95409 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZIC2O95409 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZIC2O95409 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZIC2O95409 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZIC2O95409 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZIC2O95409 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZIC2O95409 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZIC2O95409 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZIC2O95409 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZIC2O95409 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZIC2O95409 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZIC2O95409 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZIC2O95409 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZIC2O95409 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZIC2O95409 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ZIC2O95409 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZIC2O95409 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZIC2O95409 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZIC2O95409 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZIC2O95409 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZIC2O95409 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZIC2O95409 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ZIC2O95409 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ZIC2O95409 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZIC2O95409 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ZIC2O95409 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZIC2O95409 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZIC2O95409 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZIC2O95409 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZIC2O95409 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZIC2O95409 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZIC2O95409 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZIC2O95409 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZIC2O95409 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZIC2O95409 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZIC2O95409 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZIC2O95409 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZIC2O95409 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZIC2O95409 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ZIC2O95409 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ZIC2O95409 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZIC2O95409 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZIC2O95409 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZIC2O95409 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZIC2O95409 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZIC2O95409 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZIC2O95409 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZIC2O95409 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZIC2O95409 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZIC2O95409 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZIC2O95409 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZIC2O95409 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZIC2O95409 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZIC2O95409 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZIC2O95409 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZIC2O95409 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZIC2O95409 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ZIC2O95409 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZIC2O95409 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZIC2O95409 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZIC2O95409 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZIC2O95409 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms