Protein–RNA interactions for Protein: O95257

GADD45G, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 gamma, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GO95257 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GADD45GO95257 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GADD45GO95257 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GADD45GO95257 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GADD45GO95257 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GADD45GO95257 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GADD45GO95257 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GADD45GO95257 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GADD45GO95257 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GADD45GO95257 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
GADD45GO95257 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GADD45GO95257 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GADD45GO95257 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GADD45GO95257 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GADD45GO95257 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GADD45GO95257 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GADD45GO95257 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GADD45GO95257 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GADD45GO95257 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GADD45GO95257 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GADD45GO95257 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GADD45GO95257 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GADD45GO95257 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GADD45GO95257 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GADD45GO95257 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GADD45GO95257 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GADD45GO95257 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GADD45GO95257 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GADD45GO95257 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GADD45GO95257 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GADD45GO95257 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GADD45GO95257 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GADD45GO95257 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GADD45GO95257 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GADD45GO95257 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GADD45GO95257 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GADD45GO95257 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GADD45GO95257 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GADD45GO95257 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GADD45GO95257 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GADD45GO95257 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GADD45GO95257 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GADD45GO95257 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GADD45GO95257 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GADD45GO95257 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GADD45GO95257 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GADD45GO95257 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GADD45GO95257 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GADD45GO95257 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GADD45GO95257 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GADD45GO95257 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GADD45GO95257 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GADD45GO95257 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GADD45GO95257 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GADD45GO95257 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GADD45GO95257 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GADD45GO95257 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GADD45GO95257 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GADD45GO95257 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GADD45GO95257 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GADD45GO95257 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GADD45GO95257 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GADD45GO95257 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GADD45GO95257 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GADD45GO95257 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GADD45GO95257 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GADD45GO95257 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GADD45GO95257 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GADD45GO95257 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GADD45GO95257 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GADD45GO95257 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GADD45GO95257 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GADD45GO95257 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GADD45GO95257 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GADD45GO95257 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GADD45GO95257 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GADD45GO95257 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GADD45GO95257 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GADD45GO95257 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GADD45GO95257 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GADD45GO95257 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GADD45GO95257 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GADD45GO95257 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GADD45GO95257 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GADD45GO95257 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GADD45GO95257 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GADD45GO95257 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GADD45GO95257 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GADD45GO95257 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GADD45GO95257 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GADD45GO95257 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GADD45GO95257 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GADD45GO95257 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GADD45GO95257 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GADD45GO95257 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GADD45GO95257 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GADD45GO95257 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GADD45GO95257 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GADD45GO95257 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GADD45GO95257 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms