Protein–RNA interactions for Protein: O95096

NKX2-2, Homeobox protein Nkx-2.2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-2O95096 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NKX2-2O95096 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NKX2-2O95096 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NKX2-2O95096 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NKX2-2O95096 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NKX2-2O95096 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NKX2-2O95096 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NKX2-2O95096 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NKX2-2O95096 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NKX2-2O95096 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NKX2-2O95096 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NKX2-2O95096 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NKX2-2O95096 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NKX2-2O95096 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NKX2-2O95096 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NKX2-2O95096 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NKX2-2O95096 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NKX2-2O95096 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NKX2-2O95096 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NKX2-2O95096 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NKX2-2O95096 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NKX2-2O95096 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NKX2-2O95096 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NKX2-2O95096 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NKX2-2O95096 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NKX2-2O95096 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NKX2-2O95096 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NKX2-2O95096 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NKX2-2O95096 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NKX2-2O95096 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NKX2-2O95096 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NKX2-2O95096 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NKX2-2O95096 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NKX2-2O95096 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NKX2-2O95096 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NKX2-2O95096 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NKX2-2O95096 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NKX2-2O95096 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NKX2-2O95096 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NKX2-2O95096 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NKX2-2O95096 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NKX2-2O95096 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NKX2-2O95096 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NKX2-2O95096 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NKX2-2O95096 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NKX2-2O95096 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NKX2-2O95096 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NKX2-2O95096 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NKX2-2O95096 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NKX2-2O95096 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NKX2-2O95096 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NKX2-2O95096 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NKX2-2O95096 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NKX2-2O95096 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NKX2-2O95096 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NKX2-2O95096 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NKX2-2O95096 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NKX2-2O95096 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NKX2-2O95096 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NKX2-2O95096 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NKX2-2O95096 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NKX2-2O95096 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NKX2-2O95096 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NKX2-2O95096 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NKX2-2O95096 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NKX2-2O95096 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NKX2-2O95096 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NKX2-2O95096 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NKX2-2O95096 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NKX2-2O95096 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NKX2-2O95096 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NKX2-2O95096 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NKX2-2O95096 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NKX2-2O95096 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NKX2-2O95096 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NKX2-2O95096 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NKX2-2O95096 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NKX2-2O95096 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NKX2-2O95096 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NKX2-2O95096 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NKX2-2O95096 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NKX2-2O95096 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NKX2-2O95096 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NKX2-2O95096 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NKX2-2O95096 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NKX2-2O95096 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NKX2-2O95096 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NKX2-2O95096 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NKX2-2O95096 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NKX2-2O95096 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NKX2-2O95096 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NKX2-2O95096 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NKX2-2O95096 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NKX2-2O95096 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NKX2-2O95096 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NKX2-2O95096 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NKX2-2O95096 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NKX2-2O95096 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NKX2-2O95096 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NKX2-2O95096 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms