Protein–RNA interactions for Protein: O94985

CLSTN1, Calsyntenin-1, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN1O94985 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLSTN1O94985 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLSTN1O94985 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLSTN1O94985 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLSTN1O94985 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLSTN1O94985 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLSTN1O94985 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLSTN1O94985 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLSTN1O94985 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLSTN1O94985 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLSTN1O94985 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLSTN1O94985 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLSTN1O94985 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLSTN1O94985 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLSTN1O94985 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLSTN1O94985 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLSTN1O94985 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLSTN1O94985 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLSTN1O94985 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLSTN1O94985 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CLSTN1O94985 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CLSTN1O94985 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLSTN1O94985 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLSTN1O94985 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLSTN1O94985 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLSTN1O94985 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLSTN1O94985 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLSTN1O94985 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLSTN1O94985 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLSTN1O94985 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLSTN1O94985 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLSTN1O94985 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLSTN1O94985 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLSTN1O94985 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLSTN1O94985 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLSTN1O94985 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLSTN1O94985 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLSTN1O94985 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLSTN1O94985 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLSTN1O94985 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLSTN1O94985 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLSTN1O94985 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLSTN1O94985 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLSTN1O94985 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CLSTN1O94985 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLSTN1O94985 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLSTN1O94985 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CLSTN1O94985 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLSTN1O94985 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLSTN1O94985 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLSTN1O94985 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLSTN1O94985 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLSTN1O94985 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLSTN1O94985 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLSTN1O94985 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLSTN1O94985 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLSTN1O94985 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLSTN1O94985 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLSTN1O94985 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLSTN1O94985 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CLSTN1O94985 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLSTN1O94985 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLSTN1O94985 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLSTN1O94985 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLSTN1O94985 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLSTN1O94985 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CLSTN1O94985 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLSTN1O94985 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLSTN1O94985 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLSTN1O94985 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLSTN1O94985 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLSTN1O94985 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CLSTN1O94985 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLSTN1O94985 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLSTN1O94985 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLSTN1O94985 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLSTN1O94985 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLSTN1O94985 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLSTN1O94985 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLSTN1O94985 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLSTN1O94985 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLSTN1O94985 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLSTN1O94985 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLSTN1O94985 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLSTN1O94985 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLSTN1O94985 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLSTN1O94985 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLSTN1O94985 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLSTN1O94985 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CLSTN1O94985 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLSTN1O94985 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLSTN1O94985 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLSTN1O94985 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CLSTN1O94985 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLSTN1O94985 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLSTN1O94985 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLSTN1O94985 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CLSTN1O94985 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLSTN1O94985 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLSTN1O94985 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms