Protein–RNA interactions for Protein: O94898

LRIG2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,065 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG2O94898 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRIG2O94898 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRIG2O94898 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRIG2O94898 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRIG2O94898 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRIG2O94898 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRIG2O94898 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRIG2O94898 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRIG2O94898 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRIG2O94898 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRIG2O94898 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRIG2O94898 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRIG2O94898 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRIG2O94898 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRIG2O94898 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRIG2O94898 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRIG2O94898 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
LRIG2O94898 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRIG2O94898 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
LRIG2O94898 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRIG2O94898 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRIG2O94898 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRIG2O94898 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRIG2O94898 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRIG2O94898 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRIG2O94898 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
LRIG2O94898 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRIG2O94898 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRIG2O94898 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRIG2O94898 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
LRIG2O94898 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRIG2O94898 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRIG2O94898 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRIG2O94898 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRIG2O94898 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRIG2O94898 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRIG2O94898 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRIG2O94898 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRIG2O94898 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRIG2O94898 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRIG2O94898 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
LRIG2O94898 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRIG2O94898 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
LRIG2O94898 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRIG2O94898 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRIG2O94898 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRIG2O94898 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRIG2O94898 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRIG2O94898 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
LRIG2O94898 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRIG2O94898 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRIG2O94898 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRIG2O94898 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRIG2O94898 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRIG2O94898 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRIG2O94898 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRIG2O94898 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRIG2O94898 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRIG2O94898 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRIG2O94898 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRIG2O94898 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
LRIG2O94898 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRIG2O94898 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRIG2O94898 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRIG2O94898 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRIG2O94898 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
LRIG2O94898 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRIG2O94898 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRIG2O94898 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRIG2O94898 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRIG2O94898 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRIG2O94898 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRIG2O94898 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRIG2O94898 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRIG2O94898 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRIG2O94898 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRIG2O94898 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRIG2O94898 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRIG2O94898 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRIG2O94898 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRIG2O94898 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRIG2O94898 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRIG2O94898 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRIG2O94898 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRIG2O94898 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRIG2O94898 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRIG2O94898 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
LRIG2O94898 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRIG2O94898 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRIG2O94898 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRIG2O94898 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRIG2O94898 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRIG2O94898 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRIG2O94898 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
LRIG2O94898 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRIG2O94898 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRIG2O94898 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRIG2O94898 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRIG2O94898 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRIG2O94898 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms