Protein–RNA interactions for Protein: O94769

ECM2, Extracellular matrix protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM2O94769 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ECM2O94769 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ECM2O94769 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ECM2O94769 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ECM2O94769 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ECM2O94769 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ECM2O94769 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ECM2O94769 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ECM2O94769 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ECM2O94769 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ECM2O94769 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ECM2O94769 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ECM2O94769 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ECM2O94769 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ECM2O94769 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ECM2O94769 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ECM2O94769 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ECM2O94769 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
ECM2O94769 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ECM2O94769 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
ECM2O94769 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ECM2O94769 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ECM2O94769 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ECM2O94769 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ECM2O94769 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ECM2O94769 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ECM2O94769 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ECM2O94769 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ECM2O94769 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ECM2O94769 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ECM2O94769 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
ECM2O94769 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
ECM2O94769 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ECM2O94769 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
ECM2O94769 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ECM2O94769 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ECM2O94769 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ECM2O94769 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ECM2O94769 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ECM2O94769 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ECM2O94769 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ECM2O94769 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ECM2O94769 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ECM2O94769 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ECM2O94769 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ECM2O94769 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ECM2O94769 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ECM2O94769 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
ECM2O94769 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ECM2O94769 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ECM2O94769 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ECM2O94769 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ECM2O94769 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ECM2O94769 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ECM2O94769 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ECM2O94769 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ECM2O94769 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
ECM2O94769 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ECM2O94769 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ECM2O94769 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ECM2O94769 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ECM2O94769 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ECM2O94769 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ECM2O94769 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ECM2O94769 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ECM2O94769 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ECM2O94769 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ECM2O94769 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ECM2O94769 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ECM2O94769 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ECM2O94769 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ECM2O94769 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ECM2O94769 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ECM2O94769 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ECM2O94769 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ECM2O94769 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ECM2O94769 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ECM2O94769 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ECM2O94769 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ECM2O94769 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ECM2O94769 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ECM2O94769 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ECM2O94769 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ECM2O94769 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ECM2O94769 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ECM2O94769 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ECM2O94769 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ECM2O94769 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ECM2O94769 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ECM2O94769 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ECM2O94769 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ECM2O94769 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
ECM2O94769 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
ECM2O94769 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ECM2O94769 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ECM2O94769 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ECM2O94769 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ECM2O94769 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
ECM2O94769 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ECM2O94769 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 380.7 ms