Protein–RNA interactions for Protein: O75901

RASSF9, Ras association domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF9O75901 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RASSF9O75901 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RASSF9O75901 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RASSF9O75901 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RASSF9O75901 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RASSF9O75901 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RASSF9O75901 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RASSF9O75901 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RASSF9O75901 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RASSF9O75901 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RASSF9O75901 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RASSF9O75901 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RASSF9O75901 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RASSF9O75901 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RASSF9O75901 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RASSF9O75901 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RASSF9O75901 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RASSF9O75901 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RASSF9O75901 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RASSF9O75901 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RASSF9O75901 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RASSF9O75901 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RASSF9O75901 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RASSF9O75901 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RASSF9O75901 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RASSF9O75901 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RASSF9O75901 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RASSF9O75901 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RASSF9O75901 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RASSF9O75901 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RASSF9O75901 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RASSF9O75901 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RASSF9O75901 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RASSF9O75901 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RASSF9O75901 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RASSF9O75901 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RASSF9O75901 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RASSF9O75901 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RASSF9O75901 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RASSF9O75901 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RASSF9O75901 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RASSF9O75901 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RASSF9O75901 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RASSF9O75901 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RASSF9O75901 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RASSF9O75901 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RASSF9O75901 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RASSF9O75901 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RASSF9O75901 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RASSF9O75901 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RASSF9O75901 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RASSF9O75901 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RASSF9O75901 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RASSF9O75901 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RASSF9O75901 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RASSF9O75901 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RASSF9O75901 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RASSF9O75901 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RASSF9O75901 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RASSF9O75901 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RASSF9O75901 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RASSF9O75901 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RASSF9O75901 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RASSF9O75901 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RASSF9O75901 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RASSF9O75901 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RASSF9O75901 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RASSF9O75901 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RASSF9O75901 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RASSF9O75901 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RASSF9O75901 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RASSF9O75901 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RASSF9O75901 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RASSF9O75901 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RASSF9O75901 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RASSF9O75901 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RASSF9O75901 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RASSF9O75901 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RASSF9O75901 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RASSF9O75901 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RASSF9O75901 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RASSF9O75901 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RASSF9O75901 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RASSF9O75901 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RASSF9O75901 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RASSF9O75901 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RASSF9O75901 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RASSF9O75901 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RASSF9O75901 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RASSF9O75901 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RASSF9O75901 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RASSF9O75901 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RASSF9O75901 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RASSF9O75901 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RASSF9O75901 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RASSF9O75901 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RASSF9O75901 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RASSF9O75901 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RASSF9O75901 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RASSF9O75901 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms