Protein–RNA interactions for Protein: O75607

NPM3, Nucleoplasmin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPM3O75607 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
NPM3O75607 KRTAP4-4-201ENST00000390661 1081 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
NPM3O75607 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NPM3O75607 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NPM3O75607 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NPM3O75607 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NPM3O75607 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NPM3O75607 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NPM3O75607 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.55■■■□□ 2
NPM3O75607 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NPM3O75607 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.55■■■□□ 2
NPM3O75607 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NPM3O75607 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.55■■■□□ 2
NPM3O75607 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NPM3O75607 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NPM3O75607 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC27.55■■■□□ 2
NPM3O75607 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NPM3O75607 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NPM3O75607 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NPM3O75607 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NPM3O75607 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NPM3O75607 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NPM3O75607 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NPM3O75607 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NPM3O75607 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.53■■■□□ 2
NPM3O75607 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NPM3O75607 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NPM3O75607 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NPM3O75607 AC092068.1-201ENST00000592525 454 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NPM3O75607 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NPM3O75607 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NPM3O75607 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NPM3O75607 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.51■■■□□ 2
NPM3O75607 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
NPM3O75607 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
NPM3O75607 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NPM3O75607 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NPM3O75607 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NPM3O75607 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NPM3O75607 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NPM3O75607 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NPM3O75607 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NPM3O75607 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NPM3O75607 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NPM3O75607 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NPM3O75607 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NPM3O75607 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NPM3O75607 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NPM3O75607 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NPM3O75607 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NPM3O75607 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NPM3O75607 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NPM3O75607 AC073575.1-201ENST00000551125 596 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NPM3O75607 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NPM3O75607 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NPM3O75607 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NPM3O75607 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NPM3O75607 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NPM3O75607 AC005786.4-201ENST00000623369 682 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
NPM3O75607 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NPM3O75607 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NPM3O75607 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NPM3O75607 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NPM3O75607 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NPM3O75607 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NPM3O75607 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NPM3O75607 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NPM3O75607 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NPM3O75607 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NPM3O75607 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NPM3O75607 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NPM3O75607 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NPM3O75607 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NPM3O75607 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NPM3O75607 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
NPM3O75607 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NPM3O75607 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NPM3O75607 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NPM3O75607 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NPM3O75607 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NPM3O75607 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
NPM3O75607 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NPM3O75607 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NPM3O75607 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NPM3O75607 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NPM3O75607 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NPM3O75607 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NPM3O75607 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NPM3O75607 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NPM3O75607 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NPM3O75607 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NPM3O75607 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NPM3O75607 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NPM3O75607 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NPM3O75607 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NPM3O75607 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NPM3O75607 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NPM3O75607 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NPM3O75607 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NPM3O75607 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms