Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PPFIA3O75145 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PPFIA3O75145 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PPFIA3O75145 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PPFIA3O75145 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PPFIA3O75145 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PPFIA3O75145 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PPFIA3O75145 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PPFIA3O75145 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PPFIA3O75145 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PPFIA3O75145 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PPFIA3O75145 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PPFIA3O75145 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PPFIA3O75145 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PPFIA3O75145 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PPFIA3O75145 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PPFIA3O75145 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PPFIA3O75145 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PPFIA3O75145 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PPFIA3O75145 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PPFIA3O75145 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PPFIA3O75145 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PPFIA3O75145 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PPFIA3O75145 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PPFIA3O75145 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PPFIA3O75145 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PPFIA3O75145 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PPFIA3O75145 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PPFIA3O75145 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PPFIA3O75145 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PPFIA3O75145 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PPFIA3O75145 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PPFIA3O75145 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PPFIA3O75145 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PPFIA3O75145 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PPFIA3O75145 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PPFIA3O75145 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PPFIA3O75145 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PPFIA3O75145 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PPFIA3O75145 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PPFIA3O75145 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PPFIA3O75145 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PPFIA3O75145 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PPFIA3O75145 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PPFIA3O75145 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PPFIA3O75145 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PPFIA3O75145 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PPFIA3O75145 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PPFIA3O75145 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PPFIA3O75145 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PPFIA3O75145 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PPFIA3O75145 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PPFIA3O75145 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PPFIA3O75145 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PPFIA3O75145 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PPFIA3O75145 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PPFIA3O75145 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PPFIA3O75145 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PPFIA3O75145 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PPFIA3O75145 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PPFIA3O75145 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PPFIA3O75145 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PPFIA3O75145 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PPFIA3O75145 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PPFIA3O75145 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PPFIA3O75145 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PPFIA3O75145 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PPFIA3O75145 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PPFIA3O75145 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PPFIA3O75145 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PPFIA3O75145 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PPFIA3O75145 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PPFIA3O75145 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PPFIA3O75145 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PPFIA3O75145 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PPFIA3O75145 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PPFIA3O75145 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PPFIA3O75145 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PPFIA3O75145 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PPFIA3O75145 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PPFIA3O75145 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PPFIA3O75145 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PPFIA3O75145 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PPFIA3O75145 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PPFIA3O75145 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PPFIA3O75145 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PPFIA3O75145 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PPFIA3O75145 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PPFIA3O75145 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PPFIA3O75145 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PPFIA3O75145 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PPFIA3O75145 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PPFIA3O75145 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PPFIA3O75145 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PPFIA3O75145 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PPFIA3O75145 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PPFIA3O75145 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PPFIA3O75145 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PPFIA3O75145 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PPFIA3O75145 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms