Protein–RNA interactions for Protein: O75143

ATG13, Autophagy-related protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13O75143 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATG13O75143 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATG13O75143 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATG13O75143 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATG13O75143 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATG13O75143 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ATG13O75143 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATG13O75143 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATG13O75143 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATG13O75143 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATG13O75143 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ATG13O75143 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ATG13O75143 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATG13O75143 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATG13O75143 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATG13O75143 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATG13O75143 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATG13O75143 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATG13O75143 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATG13O75143 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATG13O75143 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATG13O75143 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATG13O75143 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATG13O75143 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATG13O75143 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATG13O75143 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATG13O75143 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ATG13O75143 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ATG13O75143 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATG13O75143 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATG13O75143 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATG13O75143 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATG13O75143 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATG13O75143 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATG13O75143 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATG13O75143 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATG13O75143 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATG13O75143 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATG13O75143 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ATG13O75143 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATG13O75143 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATG13O75143 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATG13O75143 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATG13O75143 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATG13O75143 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATG13O75143 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATG13O75143 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATG13O75143 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATG13O75143 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ATG13O75143 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATG13O75143 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATG13O75143 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATG13O75143 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATG13O75143 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATG13O75143 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATG13O75143 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATG13O75143 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ATG13O75143 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ATG13O75143 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATG13O75143 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATG13O75143 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATG13O75143 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG13O75143 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG13O75143 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG13O75143 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG13O75143 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG13O75143 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG13O75143 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG13O75143 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG13O75143 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG13O75143 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG13O75143 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG13O75143 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG13O75143 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG13O75143 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG13O75143 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATG13O75143 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATG13O75143 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ATG13O75143 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATG13O75143 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATG13O75143 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATG13O75143 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATG13O75143 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATG13O75143 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATG13O75143 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATG13O75143 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATG13O75143 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATG13O75143 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATG13O75143 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATG13O75143 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATG13O75143 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATG13O75143 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATG13O75143 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATG13O75143 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATG13O75143 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATG13O75143 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATG13O75143 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATG13O75143 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATG13O75143 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATG13O75143 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms