Protein–RNA interactions for Protein: O60711

LPXN, Leupaxin, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPXNO60711 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
LPXNO60711 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LPXNO60711 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LPXNO60711 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LPXNO60711 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LPXNO60711 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LPXNO60711 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LPXNO60711 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LPXNO60711 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LPXNO60711 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LPXNO60711 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LPXNO60711 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LPXNO60711 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
LPXNO60711 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LPXNO60711 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
LPXNO60711 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
LPXNO60711 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
LPXNO60711 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LPXNO60711 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LPXNO60711 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LPXNO60711 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LPXNO60711 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LPXNO60711 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LPXNO60711 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LPXNO60711 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LPXNO60711 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LPXNO60711 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LPXNO60711 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LPXNO60711 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LPXNO60711 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LPXNO60711 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LPXNO60711 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
LPXNO60711 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LPXNO60711 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LPXNO60711 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LPXNO60711 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LPXNO60711 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LPXNO60711 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LPXNO60711 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LPXNO60711 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LPXNO60711 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LPXNO60711 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LPXNO60711 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LPXNO60711 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LPXNO60711 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LPXNO60711 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LPXNO60711 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LPXNO60711 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LPXNO60711 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LPXNO60711 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LPXNO60711 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LPXNO60711 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LPXNO60711 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LPXNO60711 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LPXNO60711 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LPXNO60711 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LPXNO60711 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LPXNO60711 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LPXNO60711 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LPXNO60711 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LPXNO60711 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LPXNO60711 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LPXNO60711 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LPXNO60711 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LPXNO60711 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LPXNO60711 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LPXNO60711 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LPXNO60711 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LPXNO60711 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LPXNO60711 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LPXNO60711 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LPXNO60711 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LPXNO60711 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LPXNO60711 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LPXNO60711 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LPXNO60711 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LPXNO60711 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LPXNO60711 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LPXNO60711 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LPXNO60711 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
LPXNO60711 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
LPXNO60711 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LPXNO60711 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LPXNO60711 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LPXNO60711 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LPXNO60711 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LPXNO60711 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LPXNO60711 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LPXNO60711 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LPXNO60711 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LPXNO60711 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LPXNO60711 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
LPXNO60711 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LPXNO60711 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LPXNO60711 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LPXNO60711 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LPXNO60711 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LPXNO60711 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LPXNO60711 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LPXNO60711 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms