Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PPLO60437 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PPLO60437 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PPLO60437 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
PPLO60437 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PPLO60437 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PPLO60437 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PPLO60437 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PPLO60437 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PPLO60437 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PPLO60437 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PPLO60437 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PPLO60437 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PPLO60437 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
PPLO60437 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
PPLO60437 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
PPLO60437 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PPLO60437 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
PPLO60437 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PPLO60437 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PPLO60437 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PPLO60437 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
PPLO60437 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
PPLO60437 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
PPLO60437 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
PPLO60437 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PPLO60437 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PPLO60437 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PPLO60437 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PPLO60437 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PPLO60437 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PPLO60437 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PPLO60437 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
PPLO60437 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PPLO60437 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
PPLO60437 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
PPLO60437 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
PPLO60437 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PPLO60437 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
PPLO60437 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PPLO60437 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
PPLO60437 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PPLO60437 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PPLO60437 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PPLO60437 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PPLO60437 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
PPLO60437 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PPLO60437 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
PPLO60437 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PPLO60437 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
PPLO60437 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PPLO60437 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
PPLO60437 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PPLO60437 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
PPLO60437 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
PPLO60437 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
PPLO60437 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PPLO60437 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
PPLO60437 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
PPLO60437 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PPLO60437 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
PPLO60437 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
PPLO60437 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
PPLO60437 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
PPLO60437 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC33.07■■■□□ 2.88
PPLO60437 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
PPLO60437 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
PPLO60437 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
PPLO60437 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
PPLO60437 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
PPLO60437 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
PPLO60437 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PPLO60437 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PPLO60437 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
PPLO60437 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PPLO60437 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
PPLO60437 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
PPLO60437 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PPLO60437 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PPLO60437 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
PPLO60437 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
PPLO60437 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PPLO60437 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PPLO60437 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PPLO60437 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
PPLO60437 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
PPLO60437 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PPLO60437 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
PPLO60437 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC33.05■■■□□ 2.88
PPLO60437 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PPLO60437 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PPLO60437 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
PPLO60437 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PPLO60437 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PPLO60437 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PPLO60437 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
PPLO60437 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
PPLO60437 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PPLO60437 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
PPLO60437 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms