Protein–RNA interactions for Protein: O60423

ATP8B3, Phospholipid-transporting ATPase IK, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B3O60423 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP8B3O60423 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP8B3O60423 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP8B3O60423 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP8B3O60423 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP8B3O60423 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP8B3O60423 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP8B3O60423 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP8B3O60423 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP8B3O60423 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP8B3O60423 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP8B3O60423 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP8B3O60423 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP8B3O60423 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP8B3O60423 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP8B3O60423 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP8B3O60423 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP8B3O60423 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP8B3O60423 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP8B3O60423 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP8B3O60423 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP8B3O60423 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP8B3O60423 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP8B3O60423 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP8B3O60423 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP8B3O60423 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP8B3O60423 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP8B3O60423 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP8B3O60423 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP8B3O60423 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP8B3O60423 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP8B3O60423 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP8B3O60423 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP8B3O60423 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP8B3O60423 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP8B3O60423 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP8B3O60423 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP8B3O60423 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP8B3O60423 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP8B3O60423 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP8B3O60423 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP8B3O60423 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP8B3O60423 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP8B3O60423 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP8B3O60423 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP8B3O60423 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP8B3O60423 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP8B3O60423 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP8B3O60423 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP8B3O60423 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP8B3O60423 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP8B3O60423 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP8B3O60423 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP8B3O60423 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP8B3O60423 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP8B3O60423 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP8B3O60423 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP8B3O60423 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP8B3O60423 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP8B3O60423 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP8B3O60423 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP8B3O60423 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP8B3O60423 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP8B3O60423 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP8B3O60423 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP8B3O60423 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP8B3O60423 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP8B3O60423 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP8B3O60423 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP8B3O60423 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP8B3O60423 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP8B3O60423 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP8B3O60423 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP8B3O60423 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP8B3O60423 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP8B3O60423 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP8B3O60423 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP8B3O60423 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP8B3O60423 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP8B3O60423 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP8B3O60423 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP8B3O60423 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP8B3O60423 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP8B3O60423 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP8B3O60423 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP8B3O60423 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP8B3O60423 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP8B3O60423 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP8B3O60423 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP8B3O60423 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP8B3O60423 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP8B3O60423 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP8B3O60423 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP8B3O60423 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP8B3O60423 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP8B3O60423 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP8B3O60423 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP8B3O60423 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP8B3O60423 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP8B3O60423 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms