Protein–RNA interactions for Protein: O60312

ATP10A, Probable phospholipid-transporting ATPase VA, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP10AO60312 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC35.01■■■■□ 3.19
ATP10AO60312 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
ATP10AO60312 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC35■■■■□ 3.19
ATP10AO60312 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
ATP10AO60312 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
ATP10AO60312 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
ATP10AO60312 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
ATP10AO60312 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
ATP10AO60312 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
ATP10AO60312 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
ATP10AO60312 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
ATP10AO60312 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
ATP10AO60312 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
ATP10AO60312 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
ATP10AO60312 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
ATP10AO60312 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
ATP10AO60312 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
ATP10AO60312 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
ATP10AO60312 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
ATP10AO60312 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC34.97■■■■□ 3.19
ATP10AO60312 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
ATP10AO60312 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
ATP10AO60312 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
ATP10AO60312 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
ATP10AO60312 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC34.96■■■■□ 3.19
ATP10AO60312 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
ATP10AO60312 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC34.96■■■■□ 3.19
ATP10AO60312 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
ATP10AO60312 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
ATP10AO60312 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
ATP10AO60312 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
ATP10AO60312 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
ATP10AO60312 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
ATP10AO60312 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
ATP10AO60312 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
ATP10AO60312 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
ATP10AO60312 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
ATP10AO60312 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
ATP10AO60312 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
ATP10AO60312 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
ATP10AO60312 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
ATP10AO60312 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
ATP10AO60312 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC34.92■■■■□ 3.18
ATP10AO60312 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC34.92■■■■□ 3.18
ATP10AO60312 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC34.92■■■■□ 3.18
ATP10AO60312 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
ATP10AO60312 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
ATP10AO60312 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
ATP10AO60312 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
ATP10AO60312 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
ATP10AO60312 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
ATP10AO60312 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
ATP10AO60312 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
ATP10AO60312 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC34.9■■■■□ 3.18
ATP10AO60312 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
ATP10AO60312 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
ATP10AO60312 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
ATP10AO60312 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
ATP10AO60312 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
ATP10AO60312 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
ATP10AO60312 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
ATP10AO60312 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
ATP10AO60312 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
ATP10AO60312 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
ATP10AO60312 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
ATP10AO60312 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
ATP10AO60312 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
ATP10AO60312 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
ATP10AO60312 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
ATP10AO60312 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
ATP10AO60312 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
ATP10AO60312 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
ATP10AO60312 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
ATP10AO60312 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
ATP10AO60312 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
ATP10AO60312 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
ATP10AO60312 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
ATP10AO60312 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
ATP10AO60312 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
ATP10AO60312 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
ATP10AO60312 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
ATP10AO60312 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC34.87■■■■□ 3.17
ATP10AO60312 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
ATP10AO60312 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
ATP10AO60312 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
ATP10AO60312 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
ATP10AO60312 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
ATP10AO60312 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
ATP10AO60312 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC34.86■■■■□ 3.17
ATP10AO60312 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
ATP10AO60312 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
ATP10AO60312 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
ATP10AO60312 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
ATP10AO60312 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
ATP10AO60312 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
ATP10AO60312 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
ATP10AO60312 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
ATP10AO60312 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
ATP10AO60312 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC34.85■■■■□ 3.17
ATP10AO60312 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms