Protein–RNA interactions for Protein: O60294

LCMT2, tRNA wybutosine-synthesizing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCMT2O60294 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LCMT2O60294 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LCMT2O60294 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LCMT2O60294 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LCMT2O60294 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LCMT2O60294 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LCMT2O60294 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LCMT2O60294 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LCMT2O60294 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LCMT2O60294 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LCMT2O60294 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LCMT2O60294 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LCMT2O60294 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LCMT2O60294 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LCMT2O60294 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LCMT2O60294 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LCMT2O60294 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LCMT2O60294 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LCMT2O60294 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LCMT2O60294 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LCMT2O60294 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LCMT2O60294 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LCMT2O60294 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LCMT2O60294 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LCMT2O60294 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LCMT2O60294 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LCMT2O60294 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LCMT2O60294 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LCMT2O60294 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LCMT2O60294 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LCMT2O60294 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LCMT2O60294 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCMT2O60294 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LCMT2O60294 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCMT2O60294 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCMT2O60294 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCMT2O60294 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCMT2O60294 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCMT2O60294 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LCMT2O60294 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LCMT2O60294 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCMT2O60294 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LCMT2O60294 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCMT2O60294 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCMT2O60294 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCMT2O60294 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LCMT2O60294 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCMT2O60294 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCMT2O60294 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCMT2O60294 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCMT2O60294 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCMT2O60294 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCMT2O60294 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCMT2O60294 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCMT2O60294 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCMT2O60294 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCMT2O60294 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCMT2O60294 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCMT2O60294 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCMT2O60294 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCMT2O60294 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCMT2O60294 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCMT2O60294 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCMT2O60294 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCMT2O60294 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LCMT2O60294 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCMT2O60294 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LCMT2O60294 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LCMT2O60294 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LCMT2O60294 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LCMT2O60294 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LCMT2O60294 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LCMT2O60294 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LCMT2O60294 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LCMT2O60294 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LCMT2O60294 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCMT2O60294 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCMT2O60294 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCMT2O60294 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCMT2O60294 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCMT2O60294 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCMT2O60294 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCMT2O60294 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCMT2O60294 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LCMT2O60294 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCMT2O60294 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LCMT2O60294 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LCMT2O60294 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCMT2O60294 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCMT2O60294 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCMT2O60294 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCMT2O60294 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCMT2O60294 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCMT2O60294 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCMT2O60294 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LCMT2O60294 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCMT2O60294 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCMT2O60294 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCMT2O60294 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCMT2O60294 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms