Protein–RNA interactions for Protein: O60245

PCDH7, Protocadherin-7, humanhuman

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH7O60245 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDH7O60245 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDH7O60245 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDH7O60245 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDH7O60245 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDH7O60245 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDH7O60245 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDH7O60245 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDH7O60245 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDH7O60245 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDH7O60245 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDH7O60245 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDH7O60245 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDH7O60245 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDH7O60245 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDH7O60245 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDH7O60245 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDH7O60245 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDH7O60245 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDH7O60245 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDH7O60245 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDH7O60245 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDH7O60245 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDH7O60245 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDH7O60245 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDH7O60245 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDH7O60245 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PCDH7O60245 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDH7O60245 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDH7O60245 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDH7O60245 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDH7O60245 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDH7O60245 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDH7O60245 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDH7O60245 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDH7O60245 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDH7O60245 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDH7O60245 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDH7O60245 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDH7O60245 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDH7O60245 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDH7O60245 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDH7O60245 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDH7O60245 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCDH7O60245 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCDH7O60245 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PCDH7O60245 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PCDH7O60245 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PCDH7O60245 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PCDH7O60245 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCDH7O60245 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCDH7O60245 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCDH7O60245 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCDH7O60245 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCDH7O60245 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCDH7O60245 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCDH7O60245 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCDH7O60245 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCDH7O60245 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCDH7O60245 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCDH7O60245 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCDH7O60245 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCDH7O60245 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCDH7O60245 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCDH7O60245 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCDH7O60245 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCDH7O60245 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCDH7O60245 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCDH7O60245 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCDH7O60245 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCDH7O60245 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCDH7O60245 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCDH7O60245 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCDH7O60245 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCDH7O60245 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCDH7O60245 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCDH7O60245 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PCDH7O60245 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCDH7O60245 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PCDH7O60245 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCDH7O60245 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCDH7O60245 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCDH7O60245 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCDH7O60245 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCDH7O60245 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCDH7O60245 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCDH7O60245 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCDH7O60245 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCDH7O60245 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCDH7O60245 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCDH7O60245 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCDH7O60245 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCDH7O60245 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCDH7O60245 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCDH7O60245 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PCDH7O60245 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCDH7O60245 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCDH7O60245 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCDH7O60245 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCDH7O60245 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms