Protein–RNA interactions for Protein: O43790

KRT86, Keratin, type II cuticular Hb6, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT86O43790 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT86O43790 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT86O43790 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT86O43790 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT86O43790 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT86O43790 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT86O43790 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT86O43790 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT86O43790 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT86O43790 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KRT86O43790 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KRT86O43790 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT86O43790 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT86O43790 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT86O43790 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT86O43790 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT86O43790 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT86O43790 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT86O43790 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT86O43790 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT86O43790 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT86O43790 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT86O43790 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT86O43790 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT86O43790 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT86O43790 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT86O43790 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT86O43790 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT86O43790 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT86O43790 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT86O43790 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT86O43790 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT86O43790 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT86O43790 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT86O43790 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT86O43790 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT86O43790 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT86O43790 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT86O43790 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT86O43790 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT86O43790 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT86O43790 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT86O43790 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT86O43790 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT86O43790 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT86O43790 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT86O43790 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT86O43790 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT86O43790 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT86O43790 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT86O43790 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT86O43790 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT86O43790 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT86O43790 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT86O43790 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT86O43790 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KRT86O43790 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KRT86O43790 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT86O43790 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT86O43790 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT86O43790 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT86O43790 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT86O43790 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT86O43790 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT86O43790 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT86O43790 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT86O43790 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT86O43790 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT86O43790 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT86O43790 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT86O43790 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT86O43790 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT86O43790 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT86O43790 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT86O43790 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT86O43790 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT86O43790 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT86O43790 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT86O43790 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT86O43790 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT86O43790 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT86O43790 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT86O43790 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT86O43790 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT86O43790 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT86O43790 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT86O43790 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT86O43790 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT86O43790 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT86O43790 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT86O43790 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT86O43790 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT86O43790 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT86O43790 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT86O43790 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT86O43790 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT86O43790 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT86O43790 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT86O43790 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT86O43790 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms