Protein–RNA interactions for Protein: O43716

GATC, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit C, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATCO43716 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GATCO43716 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GATCO43716 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GATCO43716 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GATCO43716 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GATCO43716 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GATCO43716 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GATCO43716 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GATCO43716 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GATCO43716 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GATCO43716 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GATCO43716 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GATCO43716 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GATCO43716 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GATCO43716 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GATCO43716 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GATCO43716 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GATCO43716 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GATCO43716 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GATCO43716 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GATCO43716 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GATCO43716 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GATCO43716 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GATCO43716 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GATCO43716 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GATCO43716 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GATCO43716 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GATCO43716 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GATCO43716 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GATCO43716 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GATCO43716 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GATCO43716 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GATCO43716 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GATCO43716 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GATCO43716 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GATCO43716 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GATCO43716 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GATCO43716 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GATCO43716 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GATCO43716 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GATCO43716 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
GATCO43716 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
GATCO43716 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GATCO43716 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GATCO43716 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GATCO43716 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GATCO43716 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GATCO43716 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GATCO43716 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GATCO43716 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GATCO43716 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GATCO43716 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GATCO43716 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GATCO43716 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GATCO43716 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GATCO43716 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GATCO43716 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GATCO43716 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GATCO43716 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GATCO43716 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GATCO43716 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GATCO43716 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GATCO43716 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GATCO43716 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GATCO43716 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GATCO43716 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GATCO43716 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GATCO43716 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GATCO43716 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GATCO43716 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GATCO43716 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GATCO43716 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GATCO43716 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GATCO43716 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GATCO43716 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GATCO43716 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GATCO43716 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GATCO43716 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GATCO43716 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GATCO43716 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GATCO43716 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GATCO43716 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GATCO43716 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GATCO43716 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GATCO43716 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GATCO43716 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GATCO43716 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GATCO43716 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GATCO43716 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GATCO43716 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GATCO43716 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GATCO43716 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GATCO43716 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GATCO43716 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GATCO43716 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GATCO43716 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GATCO43716 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GATCO43716 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GATCO43716 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GATCO43716 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms