Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRPF3O43395 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRPF3O43395 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRPF3O43395 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRPF3O43395 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRPF3O43395 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRPF3O43395 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PRPF3O43395 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRPF3O43395 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRPF3O43395 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRPF3O43395 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRPF3O43395 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRPF3O43395 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRPF3O43395 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRPF3O43395 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRPF3O43395 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRPF3O43395 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRPF3O43395 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRPF3O43395 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PRPF3O43395 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRPF3O43395 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRPF3O43395 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRPF3O43395 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRPF3O43395 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRPF3O43395 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRPF3O43395 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PRPF3O43395 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRPF3O43395 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRPF3O43395 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRPF3O43395 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRPF3O43395 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRPF3O43395 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRPF3O43395 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRPF3O43395 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRPF3O43395 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PRPF3O43395 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PRPF3O43395 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRPF3O43395 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
PRPF3O43395 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRPF3O43395 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRPF3O43395 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRPF3O43395 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PRPF3O43395 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRPF3O43395 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRPF3O43395 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PRPF3O43395 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRPF3O43395 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRPF3O43395 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRPF3O43395 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRPF3O43395 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRPF3O43395 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRPF3O43395 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRPF3O43395 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRPF3O43395 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRPF3O43395 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PRPF3O43395 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRPF3O43395 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PRPF3O43395 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRPF3O43395 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRPF3O43395 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PRPF3O43395 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRPF3O43395 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRPF3O43395 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRPF3O43395 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRPF3O43395 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRPF3O43395 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRPF3O43395 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRPF3O43395 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRPF3O43395 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRPF3O43395 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRPF3O43395 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRPF3O43395 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRPF3O43395 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRPF3O43395 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRPF3O43395 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRPF3O43395 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRPF3O43395 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRPF3O43395 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRPF3O43395 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRPF3O43395 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRPF3O43395 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRPF3O43395 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRPF3O43395 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRPF3O43395 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRPF3O43395 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRPF3O43395 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRPF3O43395 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRPF3O43395 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRPF3O43395 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRPF3O43395 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRPF3O43395 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRPF3O43395 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRPF3O43395 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRPF3O43395 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRPF3O43395 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRPF3O43395 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PRPF3O43395 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRPF3O43395 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRPF3O43395 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRPF3O43395 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms