Protein–RNA interactions for Protein: O43290

SART1, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 800 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SART1O43290 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SART1O43290 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SART1O43290 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SART1O43290 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SART1O43290 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SART1O43290 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SART1O43290 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SART1O43290 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SART1O43290 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SART1O43290 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SART1O43290 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SART1O43290 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SART1O43290 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SART1O43290 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SART1O43290 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SART1O43290 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SART1O43290 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SART1O43290 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SART1O43290 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SART1O43290 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SART1O43290 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SART1O43290 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SART1O43290 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SART1O43290 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SART1O43290 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SART1O43290 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SART1O43290 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SART1O43290 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SART1O43290 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SART1O43290 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SART1O43290 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SART1O43290 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SART1O43290 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SART1O43290 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SART1O43290 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SART1O43290 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SART1O43290 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SART1O43290 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SART1O43290 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SART1O43290 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SART1O43290 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SART1O43290 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SART1O43290 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SART1O43290 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SART1O43290 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SART1O43290 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SART1O43290 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SART1O43290 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SART1O43290 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SART1O43290 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SART1O43290 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SART1O43290 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SART1O43290 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SART1O43290 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SART1O43290 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SART1O43290 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SART1O43290 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SART1O43290 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SART1O43290 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SART1O43290 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SART1O43290 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SART1O43290 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SART1O43290 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SART1O43290 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SART1O43290 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SART1O43290 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SART1O43290 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SART1O43290 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SART1O43290 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SART1O43290 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SART1O43290 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SART1O43290 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SART1O43290 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SART1O43290 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SART1O43290 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SART1O43290 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SART1O43290 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SART1O43290 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SART1O43290 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SART1O43290 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SART1O43290 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SART1O43290 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SART1O43290 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SART1O43290 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SART1O43290 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SART1O43290 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SART1O43290 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SART1O43290 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SART1O43290 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SART1O43290 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SART1O43290 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SART1O43290 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SART1O43290 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SART1O43290 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SART1O43290 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SART1O43290 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SART1O43290 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SART1O43290 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SART1O43290 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SART1O43290 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms