Protein–RNA interactions for Protein: O43272

PRODH, Proline dehydrogenase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRODHO43272 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRODHO43272 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRODHO43272 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRODHO43272 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRODHO43272 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRODHO43272 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRODHO43272 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRODHO43272 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRODHO43272 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRODHO43272 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRODHO43272 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRODHO43272 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRODHO43272 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRODHO43272 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRODHO43272 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRODHO43272 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRODHO43272 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRODHO43272 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRODHO43272 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRODHO43272 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRODHO43272 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRODHO43272 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRODHO43272 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRODHO43272 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PRODHO43272 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRODHO43272 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRODHO43272 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRODHO43272 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRODHO43272 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PRODHO43272 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRODHO43272 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRODHO43272 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRODHO43272 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRODHO43272 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRODHO43272 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRODHO43272 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRODHO43272 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRODHO43272 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRODHO43272 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRODHO43272 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRODHO43272 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRODHO43272 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRODHO43272 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PRODHO43272 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PRODHO43272 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PRODHO43272 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PRODHO43272 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PRODHO43272 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PRODHO43272 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PRODHO43272 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PRODHO43272 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PRODHO43272 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PRODHO43272 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PRODHO43272 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PRODHO43272 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PRODHO43272 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PRODHO43272 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRODHO43272 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRODHO43272 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRODHO43272 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRODHO43272 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRODHO43272 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRODHO43272 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRODHO43272 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRODHO43272 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRODHO43272 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRODHO43272 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRODHO43272 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRODHO43272 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRODHO43272 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRODHO43272 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRODHO43272 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRODHO43272 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRODHO43272 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRODHO43272 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRODHO43272 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRODHO43272 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRODHO43272 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRODHO43272 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRODHO43272 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PRODHO43272 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRODHO43272 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRODHO43272 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRODHO43272 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRODHO43272 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRODHO43272 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRODHO43272 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRODHO43272 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRODHO43272 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRODHO43272 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRODHO43272 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRODHO43272 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRODHO43272 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRODHO43272 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRODHO43272 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRODHO43272 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRODHO43272 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRODHO43272 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRODHO43272 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRODHO43272 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms