Protein–RNA interactions for Protein: O43182

ARHGAP6, Rho GTPase-activating protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 974 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP6O43182 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGAP6O43182 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGAP6O43182 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGAP6O43182 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGAP6O43182 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGAP6O43182 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGAP6O43182 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGAP6O43182 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGAP6O43182 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGAP6O43182 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARHGAP6O43182 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARHGAP6O43182 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARHGAP6O43182 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARHGAP6O43182 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARHGAP6O43182 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARHGAP6O43182 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ARHGAP6O43182 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARHGAP6O43182 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARHGAP6O43182 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARHGAP6O43182 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARHGAP6O43182 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARHGAP6O43182 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARHGAP6O43182 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARHGAP6O43182 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARHGAP6O43182 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARHGAP6O43182 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARHGAP6O43182 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARHGAP6O43182 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARHGAP6O43182 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARHGAP6O43182 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ARHGAP6O43182 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARHGAP6O43182 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARHGAP6O43182 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARHGAP6O43182 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARHGAP6O43182 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARHGAP6O43182 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ARHGAP6O43182 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ARHGAP6O43182 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ARHGAP6O43182 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARHGAP6O43182 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARHGAP6O43182 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARHGAP6O43182 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARHGAP6O43182 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARHGAP6O43182 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARHGAP6O43182 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARHGAP6O43182 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ARHGAP6O43182 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARHGAP6O43182 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARHGAP6O43182 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARHGAP6O43182 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARHGAP6O43182 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARHGAP6O43182 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARHGAP6O43182 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARHGAP6O43182 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARHGAP6O43182 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARHGAP6O43182 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARHGAP6O43182 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARHGAP6O43182 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARHGAP6O43182 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARHGAP6O43182 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARHGAP6O43182 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARHGAP6O43182 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARHGAP6O43182 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARHGAP6O43182 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARHGAP6O43182 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARHGAP6O43182 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARHGAP6O43182 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARHGAP6O43182 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARHGAP6O43182 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARHGAP6O43182 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARHGAP6O43182 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARHGAP6O43182 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ARHGAP6O43182 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARHGAP6O43182 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARHGAP6O43182 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARHGAP6O43182 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ARHGAP6O43182 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ARHGAP6O43182 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ARHGAP6O43182 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARHGAP6O43182 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARHGAP6O43182 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARHGAP6O43182 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ARHGAP6O43182 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARHGAP6O43182 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARHGAP6O43182 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARHGAP6O43182 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARHGAP6O43182 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARHGAP6O43182 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARHGAP6O43182 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARHGAP6O43182 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ARHGAP6O43182 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARHGAP6O43182 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARHGAP6O43182 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARHGAP6O43182 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARHGAP6O43182 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARHGAP6O43182 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARHGAP6O43182 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARHGAP6O43182 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARHGAP6O43182 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARHGAP6O43182 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms