Protein–RNA interactions for Protein: O43181

NDUFS4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS4O43181 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NDUFS4O43181 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDUFS4O43181 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDUFS4O43181 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDUFS4O43181 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDUFS4O43181 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDUFS4O43181 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDUFS4O43181 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDUFS4O43181 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDUFS4O43181 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDUFS4O43181 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDUFS4O43181 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDUFS4O43181 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NDUFS4O43181 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDUFS4O43181 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDUFS4O43181 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDUFS4O43181 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDUFS4O43181 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFS4O43181 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFS4O43181 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFS4O43181 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFS4O43181 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFS4O43181 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFS4O43181 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFS4O43181 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFS4O43181 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFS4O43181 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFS4O43181 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFS4O43181 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFS4O43181 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFS4O43181 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDUFS4O43181 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDUFS4O43181 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDUFS4O43181 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDUFS4O43181 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDUFS4O43181 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDUFS4O43181 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDUFS4O43181 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDUFS4O43181 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDUFS4O43181 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDUFS4O43181 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDUFS4O43181 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDUFS4O43181 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDUFS4O43181 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDUFS4O43181 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDUFS4O43181 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDUFS4O43181 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDUFS4O43181 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NDUFS4O43181 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDUFS4O43181 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDUFS4O43181 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDUFS4O43181 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDUFS4O43181 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDUFS4O43181 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDUFS4O43181 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDUFS4O43181 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDUFS4O43181 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDUFS4O43181 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDUFS4O43181 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDUFS4O43181 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDUFS4O43181 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDUFS4O43181 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDUFS4O43181 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDUFS4O43181 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDUFS4O43181 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDUFS4O43181 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDUFS4O43181 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDUFS4O43181 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDUFS4O43181 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
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NDUFS4O43181 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NDUFS4O43181 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDUFS4O43181 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDUFS4O43181 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDUFS4O43181 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDUFS4O43181 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDUFS4O43181 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDUFS4O43181 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDUFS4O43181 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDUFS4O43181 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDUFS4O43181 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDUFS4O43181 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDUFS4O43181 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDUFS4O43181 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDUFS4O43181 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDUFS4O43181 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDUFS4O43181 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDUFS4O43181 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDUFS4O43181 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NDUFS4O43181 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDUFS4O43181 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDUFS4O43181 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NDUFS4O43181 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDUFS4O43181 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDUFS4O43181 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDUFS4O43181 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDUFS4O43181 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDUFS4O43181 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDUFS4O43181 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDUFS4O43181 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
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