Protein–RNA interactions for Protein: O43157

PLXNB1, Plexin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 2,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB1O43157 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PLXNB1O43157 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
PLXNB1O43157 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PLXNB1O43157 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PLXNB1O43157 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PLXNB1O43157 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PLXNB1O43157 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PLXNB1O43157 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PLXNB1O43157 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PLXNB1O43157 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PLXNB1O43157 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PLXNB1O43157 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PLXNB1O43157 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PLXNB1O43157 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PLXNB1O43157 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PLXNB1O43157 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PLXNB1O43157 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLXNB1O43157 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLXNB1O43157 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLXNB1O43157 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLXNB1O43157 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLXNB1O43157 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLXNB1O43157 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLXNB1O43157 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLXNB1O43157 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLXNB1O43157 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLXNB1O43157 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLXNB1O43157 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLXNB1O43157 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLXNB1O43157 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLXNB1O43157 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLXNB1O43157 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLXNB1O43157 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLXNB1O43157 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLXNB1O43157 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLXNB1O43157 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLXNB1O43157 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PLXNB1O43157 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLXNB1O43157 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLXNB1O43157 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLXNB1O43157 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PLXNB1O43157 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLXNB1O43157 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLXNB1O43157 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLXNB1O43157 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLXNB1O43157 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLXNB1O43157 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLXNB1O43157 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLXNB1O43157 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLXNB1O43157 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLXNB1O43157 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLXNB1O43157 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PLXNB1O43157 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PLXNB1O43157 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLXNB1O43157 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLXNB1O43157 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLXNB1O43157 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PLXNB1O43157 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLXNB1O43157 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLXNB1O43157 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLXNB1O43157 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLXNB1O43157 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLXNB1O43157 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLXNB1O43157 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLXNB1O43157 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLXNB1O43157 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLXNB1O43157 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PLXNB1O43157 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLXNB1O43157 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLXNB1O43157 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PLXNB1O43157 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PLXNB1O43157 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PLXNB1O43157 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PLXNB1O43157 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PLXNB1O43157 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PLXNB1O43157 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PLXNB1O43157 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PLXNB1O43157 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PLXNB1O43157 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PLXNB1O43157 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
PLXNB1O43157 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PLXNB1O43157 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PLXNB1O43157 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PLXNB1O43157 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PLXNB1O43157 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PLXNB1O43157 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PLXNB1O43157 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PLXNB1O43157 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PLXNB1O43157 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PLXNB1O43157 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PLXNB1O43157 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PLXNB1O43157 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PLXNB1O43157 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PLXNB1O43157 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PLXNB1O43157 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLXNB1O43157 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLXNB1O43157 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLXNB1O43157 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLXNB1O43157 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLXNB1O43157 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms