Protein–RNA interactions for Protein: O15054

KDM6B, Lysine-specific demethylase 6B, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6BO15054 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
KDM6BO15054 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
KDM6BO15054 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
KDM6BO15054 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
KDM6BO15054 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
KDM6BO15054 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
KDM6BO15054 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
KDM6BO15054 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
KDM6BO15054 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
KDM6BO15054 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
KDM6BO15054 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
KDM6BO15054 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
KDM6BO15054 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
KDM6BO15054 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
KDM6BO15054 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
KDM6BO15054 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
KDM6BO15054 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
KDM6BO15054 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
KDM6BO15054 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
KDM6BO15054 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
KDM6BO15054 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
KDM6BO15054 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
KDM6BO15054 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
KDM6BO15054 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
KDM6BO15054 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
KDM6BO15054 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
KDM6BO15054 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC36.16■■■■□ 3.38
KDM6BO15054 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC36.16■■■■□ 3.38
KDM6BO15054 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
KDM6BO15054 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
KDM6BO15054 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
KDM6BO15054 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
KDM6BO15054 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
KDM6BO15054 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
KDM6BO15054 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
KDM6BO15054 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
KDM6BO15054 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
KDM6BO15054 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.38
KDM6BO15054 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
KDM6BO15054 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
KDM6BO15054 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
KDM6BO15054 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
KDM6BO15054 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
KDM6BO15054 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
KDM6BO15054 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
KDM6BO15054 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
KDM6BO15054 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
KDM6BO15054 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
KDM6BO15054 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
KDM6BO15054 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
KDM6BO15054 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
KDM6BO15054 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
KDM6BO15054 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
KDM6BO15054 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
KDM6BO15054 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
KDM6BO15054 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
KDM6BO15054 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
KDM6BO15054 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
KDM6BO15054 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
KDM6BO15054 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
KDM6BO15054 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
KDM6BO15054 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
KDM6BO15054 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
KDM6BO15054 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
KDM6BO15054 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
KDM6BO15054 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
KDM6BO15054 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
KDM6BO15054 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
KDM6BO15054 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
KDM6BO15054 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
KDM6BO15054 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
KDM6BO15054 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
KDM6BO15054 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
KDM6BO15054 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
KDM6BO15054 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
KDM6BO15054 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
KDM6BO15054 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
KDM6BO15054 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
KDM6BO15054 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
KDM6BO15054 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
KDM6BO15054 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
KDM6BO15054 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
KDM6BO15054 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
KDM6BO15054 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
KDM6BO15054 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
KDM6BO15054 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
KDM6BO15054 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
KDM6BO15054 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
KDM6BO15054 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.05■■■■□ 3.36
KDM6BO15054 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
KDM6BO15054 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
KDM6BO15054 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
KDM6BO15054 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
KDM6BO15054 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC36.05■■■■□ 3.36
KDM6BO15054 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
KDM6BO15054 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
KDM6BO15054 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
KDM6BO15054 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
KDM6BO15054 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
KDM6BO15054 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms