Protein–RNA interactions for Protein: O14777

NDC80, Kinetochore protein NDC80 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC80O14777 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NDC80O14777 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NDC80O14777 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NDC80O14777 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NDC80O14777 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NDC80O14777 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NDC80O14777 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NDC80O14777 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NDC80O14777 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NDC80O14777 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NDC80O14777 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NDC80O14777 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NDC80O14777 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NDC80O14777 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NDC80O14777 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NDC80O14777 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NDC80O14777 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NDC80O14777 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NDC80O14777 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NDC80O14777 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NDC80O14777 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NDC80O14777 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NDC80O14777 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NDC80O14777 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NDC80O14777 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NDC80O14777 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NDC80O14777 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NDC80O14777 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NDC80O14777 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NDC80O14777 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NDC80O14777 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NDC80O14777 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NDC80O14777 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NDC80O14777 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NDC80O14777 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NDC80O14777 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NDC80O14777 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NDC80O14777 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NDC80O14777 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NDC80O14777 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NDC80O14777 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NDC80O14777 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NDC80O14777 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NDC80O14777 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NDC80O14777 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NDC80O14777 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NDC80O14777 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NDC80O14777 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NDC80O14777 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NDC80O14777 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NDC80O14777 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NDC80O14777 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NDC80O14777 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NDC80O14777 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NDC80O14777 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NDC80O14777 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NDC80O14777 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NDC80O14777 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NDC80O14777 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NDC80O14777 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NDC80O14777 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NDC80O14777 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NDC80O14777 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NDC80O14777 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NDC80O14777 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NDC80O14777 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NDC80O14777 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NDC80O14777 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NDC80O14777 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NDC80O14777 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NDC80O14777 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NDC80O14777 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NDC80O14777 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NDC80O14777 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NDC80O14777 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NDC80O14777 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NDC80O14777 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NDC80O14777 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NDC80O14777 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NDC80O14777 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NDC80O14777 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NDC80O14777 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NDC80O14777 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NDC80O14777 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NDC80O14777 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NDC80O14777 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NDC80O14777 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NDC80O14777 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NDC80O14777 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NDC80O14777 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NDC80O14777 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NDC80O14777 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NDC80O14777 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NDC80O14777 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NDC80O14777 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NDC80O14777 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NDC80O14777 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NDC80O14777 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NDC80O14777 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NDC80O14777 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms