Protein–RNA interactions for Protein: O14543

SOCS3, Suppressor of cytokine signaling 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS3O14543 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SOCS3O14543 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SOCS3O14543 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SOCS3O14543 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SOCS3O14543 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SOCS3O14543 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SOCS3O14543 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOCS3O14543 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOCS3O14543 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOCS3O14543 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOCS3O14543 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOCS3O14543 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOCS3O14543 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOCS3O14543 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOCS3O14543 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOCS3O14543 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SOCS3O14543 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOCS3O14543 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOCS3O14543 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOCS3O14543 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOCS3O14543 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOCS3O14543 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOCS3O14543 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOCS3O14543 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOCS3O14543 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SOCS3O14543 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SOCS3O14543 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SOCS3O14543 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SOCS3O14543 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SOCS3O14543 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SOCS3O14543 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SOCS3O14543 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SOCS3O14543 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SOCS3O14543 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SOCS3O14543 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SOCS3O14543 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOCS3O14543 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOCS3O14543 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOCS3O14543 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOCS3O14543 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOCS3O14543 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOCS3O14543 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOCS3O14543 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOCS3O14543 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOCS3O14543 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOCS3O14543 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOCS3O14543 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOCS3O14543 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOCS3O14543 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOCS3O14543 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOCS3O14543 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOCS3O14543 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SOCS3O14543 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOCS3O14543 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOCS3O14543 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOCS3O14543 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOCS3O14543 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOCS3O14543 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOCS3O14543 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOCS3O14543 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOCS3O14543 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOCS3O14543 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOCS3O14543 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SOCS3O14543 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOCS3O14543 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOCS3O14543 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOCS3O14543 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SOCS3O14543 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOCS3O14543 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOCS3O14543 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOCS3O14543 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SOCS3O14543 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOCS3O14543 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOCS3O14543 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOCS3O14543 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOCS3O14543 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOCS3O14543 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOCS3O14543 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOCS3O14543 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOCS3O14543 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SOCS3O14543 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOCS3O14543 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOCS3O14543 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOCS3O14543 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOCS3O14543 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOCS3O14543 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOCS3O14543 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOCS3O14543 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOCS3O14543 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOCS3O14543 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SOCS3O14543 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SOCS3O14543 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SOCS3O14543 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SOCS3O14543 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SOCS3O14543 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SOCS3O14543 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SOCS3O14543 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SOCS3O14543 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SOCS3O14543 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SOCS3O14543 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms