Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
PTPRTO14522 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
PTPRTO14522 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
PTPRTO14522 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
PTPRTO14522 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
PTPRTO14522 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
PTPRTO14522 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
PTPRTO14522 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC34.22■■■■□ 3.07
PTPRTO14522 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
PTPRTO14522 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PTPRTO14522 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC34.21■■■■□ 3.07
PTPRTO14522 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
PTPRTO14522 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
PTPRTO14522 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
PTPRTO14522 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
PTPRTO14522 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PTPRTO14522 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
PTPRTO14522 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
PTPRTO14522 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
PTPRTO14522 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC34.2■■■■□ 3.06
PTPRTO14522 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.06
PTPRTO14522 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
PTPRTO14522 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PTPRTO14522 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PTPRTO14522 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
PTPRTO14522 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
PTPRTO14522 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC34.19■■■■□ 3.06
PTPRTO14522 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PTPRTO14522 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PTPRTO14522 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PTPRTO14522 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PTPRTO14522 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
PTPRTO14522 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PTPRTO14522 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PTPRTO14522 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PTPRTO14522 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PTPRTO14522 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PTPRTO14522 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
PTPRTO14522 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
PTPRTO14522 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
PTPRTO14522 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
PTPRTO14522 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
PTPRTO14522 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
PTPRTO14522 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
PTPRTO14522 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PTPRTO14522 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PTPRTO14522 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PTPRTO14522 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
PTPRTO14522 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
PTPRTO14522 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PTPRTO14522 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PTPRTO14522 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PTPRTO14522 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
PTPRTO14522 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
PTPRTO14522 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
PTPRTO14522 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
PTPRTO14522 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
PTPRTO14522 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PTPRTO14522 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PTPRTO14522 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
PTPRTO14522 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC34.14■■■■□ 3.06
PTPRTO14522 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
PTPRTO14522 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
PTPRTO14522 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
PTPRTO14522 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
PTPRTO14522 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
PTPRTO14522 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
PTPRTO14522 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
PTPRTO14522 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PTPRTO14522 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
PTPRTO14522 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
PTPRTO14522 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
PTPRTO14522 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC34.11■■■■□ 3.05
PTPRTO14522 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
PTPRTO14522 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
PTPRTO14522 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PTPRTO14522 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
PTPRTO14522 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PTPRTO14522 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
PTPRTO14522 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
PTPRTO14522 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
PTPRTO14522 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PTPRTO14522 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PTPRTO14522 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
PTPRTO14522 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
PTPRTO14522 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
PTPRTO14522 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
PTPRTO14522 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
PTPRTO14522 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
PTPRTO14522 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
PTPRTO14522 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PTPRTO14522 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PTPRTO14522 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PTPRTO14522 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
PTPRTO14522 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PTPRTO14522 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
PTPRTO14522 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PTPRTO14522 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PTPRTO14522 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PTPRTO14522 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
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