Protein–RNA interactions for Protein: O00712

NFIB, Nuclear factor 1 B-type, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIBO00712 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NFIBO00712 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NFIBO00712 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NFIBO00712 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NFIBO00712 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NFIBO00712 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NFIBO00712 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NFIBO00712 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NFIBO00712 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NFIBO00712 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NFIBO00712 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NFIBO00712 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NFIBO00712 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NFIBO00712 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NFIBO00712 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NFIBO00712 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NFIBO00712 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
NFIBO00712 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NFIBO00712 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NFIBO00712 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NFIBO00712 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
NFIBO00712 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
NFIBO00712 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NFIBO00712 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NFIBO00712 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NFIBO00712 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NFIBO00712 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NFIBO00712 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NFIBO00712 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NFIBO00712 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NFIBO00712 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NFIBO00712 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NFIBO00712 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NFIBO00712 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NFIBO00712 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NFIBO00712 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NFIBO00712 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NFIBO00712 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NFIBO00712 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NFIBO00712 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NFIBO00712 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NFIBO00712 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NFIBO00712 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NFIBO00712 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NFIBO00712 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NFIBO00712 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NFIBO00712 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NFIBO00712 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NFIBO00712 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NFIBO00712 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NFIBO00712 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NFIBO00712 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NFIBO00712 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NFIBO00712 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NFIBO00712 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NFIBO00712 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NFIBO00712 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NFIBO00712 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NFIBO00712 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NFIBO00712 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
NFIBO00712 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NFIBO00712 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NFIBO00712 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NFIBO00712 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NFIBO00712 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NFIBO00712 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NFIBO00712 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NFIBO00712 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NFIBO00712 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NFIBO00712 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NFIBO00712 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NFIBO00712 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NFIBO00712 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NFIBO00712 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NFIBO00712 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NFIBO00712 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NFIBO00712 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NFIBO00712 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NFIBO00712 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NFIBO00712 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NFIBO00712 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NFIBO00712 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NFIBO00712 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NFIBO00712 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NFIBO00712 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NFIBO00712 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NFIBO00712 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NFIBO00712 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NFIBO00712 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NFIBO00712 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NFIBO00712 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NFIBO00712 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
NFIBO00712 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NFIBO00712 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NFIBO00712 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NFIBO00712 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NFIBO00712 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NFIBO00712 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NFIBO00712 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NFIBO00712 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms