Protein–RNA interactions for Protein: O00273

DFFA, DNA fragmentation factor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFFAO00273 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DFFAO00273 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DFFAO00273 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DFFAO00273 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DFFAO00273 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DFFAO00273 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DFFAO00273 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DFFAO00273 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DFFAO00273 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DFFAO00273 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DFFAO00273 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DFFAO00273 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DFFAO00273 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DFFAO00273 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DFFAO00273 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DFFAO00273 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DFFAO00273 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
DFFAO00273 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DFFAO00273 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
DFFAO00273 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DFFAO00273 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DFFAO00273 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
DFFAO00273 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DFFAO00273 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DFFAO00273 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
DFFAO00273 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DFFAO00273 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DFFAO00273 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DFFAO00273 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DFFAO00273 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DFFAO00273 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DFFAO00273 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DFFAO00273 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DFFAO00273 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DFFAO00273 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DFFAO00273 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DFFAO00273 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DFFAO00273 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
DFFAO00273 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DFFAO00273 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DFFAO00273 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DFFAO00273 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DFFAO00273 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DFFAO00273 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DFFAO00273 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DFFAO00273 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DFFAO00273 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DFFAO00273 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DFFAO00273 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DFFAO00273 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DFFAO00273 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DFFAO00273 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DFFAO00273 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DFFAO00273 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DFFAO00273 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DFFAO00273 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DFFAO00273 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DFFAO00273 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DFFAO00273 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
DFFAO00273 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DFFAO00273 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
DFFAO00273 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DFFAO00273 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DFFAO00273 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DFFAO00273 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DFFAO00273 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DFFAO00273 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DFFAO00273 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DFFAO00273 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DFFAO00273 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DFFAO00273 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DFFAO00273 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DFFAO00273 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DFFAO00273 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DFFAO00273 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DFFAO00273 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DFFAO00273 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
DFFAO00273 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
DFFAO00273 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DFFAO00273 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
DFFAO00273 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DFFAO00273 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DFFAO00273 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DFFAO00273 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DFFAO00273 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
DFFAO00273 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DFFAO00273 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DFFAO00273 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DFFAO00273 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DFFAO00273 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DFFAO00273 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
DFFAO00273 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DFFAO00273 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DFFAO00273 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DFFAO00273 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DFFAO00273 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DFFAO00273 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DFFAO00273 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DFFAO00273 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DFFAO00273 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms