Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GOLGA8SH3BPF8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA8SH3BPF8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA8SH3BPF8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA8SH3BPF8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA8SH3BPF8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GOLGA8SH3BPF8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
GOLGA8SH3BPF8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GOLGA8SH3BPF8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GOLGA8SH3BPF8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GOLGA8SH3BPF8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GOLGA8SH3BPF8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GOLGA8SH3BPF8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GOLGA8SH3BPF8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA8SH3BPF8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA8SH3BPF8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA8SH3BPF8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA8SH3BPF8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA8SH3BPF8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA8SH3BPF8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA8SH3BPF8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA8SH3BPF8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA8SH3BPF8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA8SH3BPF8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA8SH3BPF8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GOLGA8SH3BPF8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GOLGA8SH3BPF8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GOLGA8SH3BPF8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GOLGA8SH3BPF8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GOLGA8SH3BPF8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GOLGA8SH3BPF8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA8SH3BPF8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA8SH3BPF8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA8SH3BPF8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA8SH3BPF8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA8SH3BPF8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA8SH3BPF8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA8SH3BPF8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GOLGA8SH3BPF8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GOLGA8SH3BPF8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GOLGA8SH3BPF8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GOLGA8SH3BPF8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GOLGA8SH3BPF8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GOLGA8SH3BPF8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GOLGA8SH3BPF8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GOLGA8SH3BPF8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GOLGA8SH3BPF8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA8SH3BPF8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA8SH3BPF8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA8SH3BPF8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA8SH3BPF8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA8SH3BPF8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA8SH3BPF8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GOLGA8SH3BPF8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GOLGA8SH3BPF8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GOLGA8SH3BPF8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GOLGA8SH3BPF8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA8SH3BPF8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA8SH3BPF8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA8SH3BPF8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA8SH3BPF8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA8SH3BPF8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA8SH3BPF8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA8SH3BPF8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA8SH3BPF8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA8SH3BPF8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA8SH3BPF8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA8SH3BPF8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA8SH3BPF8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA8SH3BPF8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA8SH3BPF8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA8SH3BPF8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA8SH3BPF8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA8SH3BPF8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA8SH3BPF8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA8SH3BPF8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA8SH3BPF8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA8SH3BPF8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA8SH3BPF8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA8SH3BPF8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA8SH3BPF8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA8SH3BPF8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA8SH3BPF8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA8SH3BPF8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA8SH3BPF8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA8SH3BPF8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA8SH3BPF8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA8SH3BPF8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA8SH3BPF8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA8SH3BPF8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA8SH3BPF8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA8SH3BPF8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA8SH3BPF8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA8SH3BPF8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA8SH3BPF8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA8SH3BPF8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA8SH3BPF8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GOLGA8SH3BPF8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GOLGA8SH3BPF8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GOLGA8SH3BPF8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms