Protein–RNA interactions for Protein: H3BNC9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BNC9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
H3BNC9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
H3BNC9 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
H3BNC9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
H3BNC9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
H3BNC9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
H3BNC9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
H3BNC9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
H3BNC9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
H3BNC9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
H3BNC9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
H3BNC9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
H3BNC9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
H3BNC9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
H3BNC9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
H3BNC9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
H3BNC9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
H3BNC9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
H3BNC9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
H3BNC9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
H3BNC9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
H3BNC9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
H3BNC9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
H3BNC9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
H3BNC9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
H3BNC9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
H3BNC9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
H3BNC9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
H3BNC9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
H3BNC9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
H3BNC9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
H3BNC9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
H3BNC9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
H3BNC9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
H3BNC9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
H3BNC9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
H3BNC9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
H3BNC9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
H3BNC9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
H3BNC9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
H3BNC9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
H3BNC9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
H3BNC9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
H3BNC9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
H3BNC9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
H3BNC9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
H3BNC9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
H3BNC9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
H3BNC9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
H3BNC9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
H3BNC9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
H3BNC9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
H3BNC9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
H3BNC9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
H3BNC9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
H3BNC9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
H3BNC9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
H3BNC9 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
H3BNC9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
H3BNC9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
H3BNC9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
H3BNC9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
H3BNC9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
H3BNC9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
H3BNC9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
H3BNC9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
H3BNC9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
H3BNC9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
H3BNC9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
H3BNC9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
H3BNC9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
H3BNC9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
H3BNC9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
H3BNC9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
H3BNC9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
H3BNC9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
H3BNC9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
H3BNC9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
H3BNC9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
H3BNC9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
H3BNC9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
H3BNC9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
H3BNC9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
H3BNC9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
H3BNC9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
H3BNC9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
H3BNC9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
H3BNC9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
H3BNC9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
H3BNC9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
H3BNC9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
H3BNC9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
H3BNC9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
H3BNC9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
H3BNC9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
H3BNC9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
H3BNC9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
H3BNC9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
H3BNC9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
H3BNC9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms