Protein–RNA interactions for Protein: E9PMD0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PMD0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
E9PMD0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
E9PMD0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
E9PMD0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
E9PMD0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
E9PMD0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
E9PMD0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
E9PMD0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
E9PMD0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
E9PMD0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
E9PMD0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
E9PMD0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
E9PMD0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
E9PMD0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
E9PMD0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
E9PMD0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
E9PMD0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
E9PMD0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
E9PMD0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
E9PMD0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
E9PMD0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
E9PMD0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
E9PMD0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
E9PMD0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
E9PMD0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
E9PMD0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
E9PMD0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
E9PMD0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
E9PMD0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
E9PMD0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
E9PMD0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
E9PMD0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
E9PMD0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
E9PMD0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
E9PMD0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
E9PMD0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
E9PMD0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
E9PMD0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
E9PMD0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
E9PMD0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
E9PMD0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
E9PMD0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
E9PMD0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
E9PMD0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
E9PMD0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
E9PMD0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
E9PMD0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
E9PMD0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
E9PMD0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
E9PMD0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
E9PMD0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
E9PMD0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
E9PMD0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
E9PMD0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
E9PMD0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
E9PMD0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
E9PMD0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
E9PMD0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
E9PMD0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
E9PMD0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
E9PMD0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
E9PMD0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
E9PMD0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
E9PMD0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
E9PMD0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
E9PMD0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
E9PMD0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
E9PMD0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
E9PMD0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
E9PMD0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
E9PMD0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
E9PMD0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
E9PMD0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
E9PMD0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
E9PMD0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
E9PMD0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
E9PMD0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
E9PMD0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
E9PMD0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
E9PMD0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
E9PMD0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
E9PMD0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
E9PMD0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
E9PMD0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
E9PMD0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
E9PMD0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
E9PMD0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
E9PMD0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
E9PMD0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
E9PMD0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
E9PMD0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
E9PMD0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
E9PMD0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
E9PMD0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
E9PMD0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
E9PMD0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
E9PMD0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
E9PMD0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
E9PMD0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
E9PMD0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms