Protein–RNA interactions for Protein: E9PAV3

NACA, Nascent polypeptide-associated complex subunit alpha, muscle-specific form, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NACAE9PAV3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NACAE9PAV3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NACAE9PAV3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NACAE9PAV3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NACAE9PAV3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NACAE9PAV3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NACAE9PAV3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NACAE9PAV3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NACAE9PAV3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NACAE9PAV3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NACAE9PAV3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NACAE9PAV3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NACAE9PAV3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NACAE9PAV3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NACAE9PAV3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NACAE9PAV3 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NACAE9PAV3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NACAE9PAV3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NACAE9PAV3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NACAE9PAV3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NACAE9PAV3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NACAE9PAV3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NACAE9PAV3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NACAE9PAV3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NACAE9PAV3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NACAE9PAV3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NACAE9PAV3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NACAE9PAV3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NACAE9PAV3 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NACAE9PAV3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NACAE9PAV3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NACAE9PAV3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NACAE9PAV3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NACAE9PAV3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NACAE9PAV3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NACAE9PAV3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NACAE9PAV3 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NACAE9PAV3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NACAE9PAV3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NACAE9PAV3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NACAE9PAV3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NACAE9PAV3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NACAE9PAV3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NACAE9PAV3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NACAE9PAV3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NACAE9PAV3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NACAE9PAV3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NACAE9PAV3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NACAE9PAV3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NACAE9PAV3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NACAE9PAV3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NACAE9PAV3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NACAE9PAV3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NACAE9PAV3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NACAE9PAV3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NACAE9PAV3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NACAE9PAV3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NACAE9PAV3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NACAE9PAV3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NACAE9PAV3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NACAE9PAV3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NACAE9PAV3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NACAE9PAV3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NACAE9PAV3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NACAE9PAV3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NACAE9PAV3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NACAE9PAV3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NACAE9PAV3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NACAE9PAV3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NACAE9PAV3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NACAE9PAV3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NACAE9PAV3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NACAE9PAV3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NACAE9PAV3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NACAE9PAV3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NACAE9PAV3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NACAE9PAV3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NACAE9PAV3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NACAE9PAV3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NACAE9PAV3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NACAE9PAV3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NACAE9PAV3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NACAE9PAV3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NACAE9PAV3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NACAE9PAV3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NACAE9PAV3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NACAE9PAV3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NACAE9PAV3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NACAE9PAV3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NACAE9PAV3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NACAE9PAV3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NACAE9PAV3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NACAE9PAV3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NACAE9PAV3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NACAE9PAV3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NACAE9PAV3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NACAE9PAV3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NACAE9PAV3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NACAE9PAV3 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NACAE9PAV3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms