Protein–RNA interactions for Protein: C9J3I9

C5orf58, Putative uncharacterized protein C5orf58, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf58C9J3I9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C5orf58C9J3I9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C5orf58C9J3I9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C5orf58C9J3I9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C5orf58C9J3I9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C5orf58C9J3I9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C5orf58C9J3I9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C5orf58C9J3I9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C5orf58C9J3I9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C5orf58C9J3I9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C5orf58C9J3I9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C5orf58C9J3I9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C5orf58C9J3I9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C5orf58C9J3I9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C5orf58C9J3I9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C5orf58C9J3I9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C5orf58C9J3I9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C5orf58C9J3I9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C5orf58C9J3I9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C5orf58C9J3I9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C5orf58C9J3I9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C5orf58C9J3I9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C5orf58C9J3I9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C5orf58C9J3I9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C5orf58C9J3I9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C5orf58C9J3I9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C5orf58C9J3I9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C5orf58C9J3I9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C5orf58C9J3I9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C5orf58C9J3I9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C5orf58C9J3I9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C5orf58C9J3I9 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C5orf58C9J3I9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C5orf58C9J3I9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C5orf58C9J3I9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C5orf58C9J3I9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C5orf58C9J3I9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C5orf58C9J3I9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C5orf58C9J3I9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C5orf58C9J3I9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C5orf58C9J3I9 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C5orf58C9J3I9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C5orf58C9J3I9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C5orf58C9J3I9 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C5orf58C9J3I9 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C5orf58C9J3I9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C5orf58C9J3I9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C5orf58C9J3I9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
C5orf58C9J3I9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
C5orf58C9J3I9 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
C5orf58C9J3I9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C5orf58C9J3I9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
C5orf58C9J3I9 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
C5orf58C9J3I9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C5orf58C9J3I9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C5orf58C9J3I9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
C5orf58C9J3I9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C5orf58C9J3I9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C5orf58C9J3I9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
C5orf58C9J3I9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C5orf58C9J3I9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C5orf58C9J3I9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C5orf58C9J3I9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C5orf58C9J3I9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
C5orf58C9J3I9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
C5orf58C9J3I9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C5orf58C9J3I9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C5orf58C9J3I9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C5orf58C9J3I9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C5orf58C9J3I9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C5orf58C9J3I9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
C5orf58C9J3I9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C5orf58C9J3I9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C5orf58C9J3I9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C5orf58C9J3I9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C5orf58C9J3I9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C5orf58C9J3I9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C5orf58C9J3I9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C5orf58C9J3I9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C5orf58C9J3I9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C5orf58C9J3I9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C5orf58C9J3I9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C5orf58C9J3I9 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C5orf58C9J3I9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C5orf58C9J3I9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C5orf58C9J3I9 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C5orf58C9J3I9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C5orf58C9J3I9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C5orf58C9J3I9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C5orf58C9J3I9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C5orf58C9J3I9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C5orf58C9J3I9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C5orf58C9J3I9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C5orf58C9J3I9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C5orf58C9J3I9 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C5orf58C9J3I9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C5orf58C9J3I9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C5orf58C9J3I9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
C5orf58C9J3I9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
C5orf58C9J3I9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms