Protein–RNA interactions for Protein: A8MYB1

TMCO5B, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5B, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5BA8MYB1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMCO5BA8MYB1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMCO5BA8MYB1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMCO5BA8MYB1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMCO5BA8MYB1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMCO5BA8MYB1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMCO5BA8MYB1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMCO5BA8MYB1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMCO5BA8MYB1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMCO5BA8MYB1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMCO5BA8MYB1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMCO5BA8MYB1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMCO5BA8MYB1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMCO5BA8MYB1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMCO5BA8MYB1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMCO5BA8MYB1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMCO5BA8MYB1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMCO5BA8MYB1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMCO5BA8MYB1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMCO5BA8MYB1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMCO5BA8MYB1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMCO5BA8MYB1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMCO5BA8MYB1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMCO5BA8MYB1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMCO5BA8MYB1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMCO5BA8MYB1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMCO5BA8MYB1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMCO5BA8MYB1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMCO5BA8MYB1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMCO5BA8MYB1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMCO5BA8MYB1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMCO5BA8MYB1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMCO5BA8MYB1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMCO5BA8MYB1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMCO5BA8MYB1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMCO5BA8MYB1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMCO5BA8MYB1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMCO5BA8MYB1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMCO5BA8MYB1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMCO5BA8MYB1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMCO5BA8MYB1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMCO5BA8MYB1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMCO5BA8MYB1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TMCO5BA8MYB1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMCO5BA8MYB1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TMCO5BA8MYB1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMCO5BA8MYB1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TMCO5BA8MYB1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TMCO5BA8MYB1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMCO5BA8MYB1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMCO5BA8MYB1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMCO5BA8MYB1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMCO5BA8MYB1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMCO5BA8MYB1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMCO5BA8MYB1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMCO5BA8MYB1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMCO5BA8MYB1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMCO5BA8MYB1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMCO5BA8MYB1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMCO5BA8MYB1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMCO5BA8MYB1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMCO5BA8MYB1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TMCO5BA8MYB1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMCO5BA8MYB1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMCO5BA8MYB1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMCO5BA8MYB1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMCO5BA8MYB1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMCO5BA8MYB1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMCO5BA8MYB1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMCO5BA8MYB1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMCO5BA8MYB1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMCO5BA8MYB1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TMCO5BA8MYB1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMCO5BA8MYB1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMCO5BA8MYB1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMCO5BA8MYB1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMCO5BA8MYB1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMCO5BA8MYB1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMCO5BA8MYB1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TMCO5BA8MYB1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMCO5BA8MYB1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMCO5BA8MYB1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMCO5BA8MYB1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMCO5BA8MYB1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMCO5BA8MYB1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMCO5BA8MYB1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TMCO5BA8MYB1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMCO5BA8MYB1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TMCO5BA8MYB1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMCO5BA8MYB1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMCO5BA8MYB1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMCO5BA8MYB1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMCO5BA8MYB1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMCO5BA8MYB1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMCO5BA8MYB1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMCO5BA8MYB1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMCO5BA8MYB1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMCO5BA8MYB1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMCO5BA8MYB1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMCO5BA8MYB1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms