Protein–RNA interactions for Protein: A8MVJ9

Putative histone PARylation factor 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MVJ9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
A8MVJ9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
A8MVJ9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
A8MVJ9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
A8MVJ9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
A8MVJ9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
A8MVJ9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
A8MVJ9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
A8MVJ9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
A8MVJ9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
A8MVJ9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
A8MVJ9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
A8MVJ9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
A8MVJ9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
A8MVJ9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
A8MVJ9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
A8MVJ9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
A8MVJ9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
A8MVJ9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
A8MVJ9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
A8MVJ9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
A8MVJ9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
A8MVJ9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
A8MVJ9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
A8MVJ9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
A8MVJ9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
A8MVJ9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
A8MVJ9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
A8MVJ9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
A8MVJ9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
A8MVJ9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
A8MVJ9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
A8MVJ9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
A8MVJ9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
A8MVJ9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
A8MVJ9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
A8MVJ9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
A8MVJ9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
A8MVJ9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
A8MVJ9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
A8MVJ9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
A8MVJ9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
A8MVJ9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
A8MVJ9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
A8MVJ9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
A8MVJ9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
A8MVJ9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
A8MVJ9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
A8MVJ9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
A8MVJ9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
A8MVJ9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
A8MVJ9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
A8MVJ9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
A8MVJ9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
A8MVJ9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
A8MVJ9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
A8MVJ9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
A8MVJ9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
A8MVJ9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
A8MVJ9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
A8MVJ9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
A8MVJ9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
A8MVJ9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
A8MVJ9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
A8MVJ9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
A8MVJ9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
A8MVJ9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
A8MVJ9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
A8MVJ9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
A8MVJ9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
A8MVJ9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
A8MVJ9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
A8MVJ9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
A8MVJ9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
A8MVJ9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
A8MVJ9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
A8MVJ9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
A8MVJ9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
A8MVJ9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
A8MVJ9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
A8MVJ9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
A8MVJ9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
A8MVJ9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
A8MVJ9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
A8MVJ9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
A8MVJ9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
A8MVJ9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
A8MVJ9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
A8MVJ9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
A8MVJ9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
A8MVJ9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
A8MVJ9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
A8MVJ9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
A8MVJ9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
A8MVJ9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
A8MVJ9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
A8MVJ9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
A8MVJ9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
A8MVJ9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
A8MVJ9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms