Protein–RNA interactions for Protein: A8MPX8

PP2D1, Protein phosphatase 2C-like domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PP2D1A8MPX8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PP2D1A8MPX8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PP2D1A8MPX8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PP2D1A8MPX8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PP2D1A8MPX8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PP2D1A8MPX8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PP2D1A8MPX8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PP2D1A8MPX8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PP2D1A8MPX8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PP2D1A8MPX8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PP2D1A8MPX8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PP2D1A8MPX8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PP2D1A8MPX8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PP2D1A8MPX8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PP2D1A8MPX8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PP2D1A8MPX8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PP2D1A8MPX8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PP2D1A8MPX8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PP2D1A8MPX8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PP2D1A8MPX8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PP2D1A8MPX8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PP2D1A8MPX8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PP2D1A8MPX8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PP2D1A8MPX8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PP2D1A8MPX8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PP2D1A8MPX8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PP2D1A8MPX8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PP2D1A8MPX8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PP2D1A8MPX8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PP2D1A8MPX8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PP2D1A8MPX8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PP2D1A8MPX8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PP2D1A8MPX8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PP2D1A8MPX8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PP2D1A8MPX8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PP2D1A8MPX8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PP2D1A8MPX8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PP2D1A8MPX8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PP2D1A8MPX8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PP2D1A8MPX8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PP2D1A8MPX8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PP2D1A8MPX8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PP2D1A8MPX8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PP2D1A8MPX8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PP2D1A8MPX8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
PP2D1A8MPX8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PP2D1A8MPX8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PP2D1A8MPX8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PP2D1A8MPX8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PP2D1A8MPX8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PP2D1A8MPX8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PP2D1A8MPX8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PP2D1A8MPX8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PP2D1A8MPX8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PP2D1A8MPX8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PP2D1A8MPX8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PP2D1A8MPX8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PP2D1A8MPX8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PP2D1A8MPX8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PP2D1A8MPX8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PP2D1A8MPX8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PP2D1A8MPX8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PP2D1A8MPX8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PP2D1A8MPX8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PP2D1A8MPX8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PP2D1A8MPX8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PP2D1A8MPX8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PP2D1A8MPX8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PP2D1A8MPX8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PP2D1A8MPX8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PP2D1A8MPX8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PP2D1A8MPX8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PP2D1A8MPX8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PP2D1A8MPX8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PP2D1A8MPX8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PP2D1A8MPX8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PP2D1A8MPX8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PP2D1A8MPX8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PP2D1A8MPX8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PP2D1A8MPX8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PP2D1A8MPX8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PP2D1A8MPX8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PP2D1A8MPX8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PP2D1A8MPX8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PP2D1A8MPX8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PP2D1A8MPX8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PP2D1A8MPX8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PP2D1A8MPX8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PP2D1A8MPX8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PP2D1A8MPX8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PP2D1A8MPX8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PP2D1A8MPX8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PP2D1A8MPX8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PP2D1A8MPX8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PP2D1A8MPX8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PP2D1A8MPX8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PP2D1A8MPX8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PP2D1A8MPX8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PP2D1A8MPX8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PP2D1A8MPX8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms